Dr. Diego Darriba López  

Profesor contratado doctor (PC-DR)

Departamento Ingeniería de Computadores
Área Arquitectura y tecnología de computadore
Investigación  Grupo de investigación Grupo de Arquitectura de Ordenadores
Líneas de investigación Bioinformática Filogenética Computación de Altas Prestaciones
Contacto Directorio de la UDC
Orcid id0000-0001-5482-3932 ResearcherIDN-7273-2019 Scopus37088309000

Docencia

Docencia impartida

En este apartado se muestra la docencia impartida en grados, másteres y resto de estudios oficiales en los últimos 6 años.

Asignatura y estudios en la que se imparte Horas a distancia Horas totales
Trabajo Fin de Máster
Máster Universitario en Computación de Altas Prestaciones / High Performance Computing
0 3,5
Asignatura y estudios en la que se imparte Horas a distancia Horas totales
Concurrencia y Paralelismo 0 90
Estructura de Computadores
Grado en Ingeniería Informática. Curso Puente
0 135
Fundamentos de los Computadores 0 0
Prácticas en Empresa 0 1
Programación Paralela Avanzada 0 10
Trabajo Fin de Grado. Mención en Ingeniería del Software
Grado en Ingeniería Informática. Curso Puente
0 2,5
Trabajo Fin de Grado. Mención en Tecnologías de la Información
Grado en Ingeniería Informática. Curso Puente
0 5
Trabajo Fin de Máster 0 1
Asignatura y estudios en la que se imparte Horas a distancia Horas totales
Concurrencia y Paralelismo
Grado en Ingeniería Informática
0 60
Estructura de Computadores
Grado en Ingeniería Informática
Grado en Ingeniería Informática. Curso Puente
Máster Universitario en Ingeniería Informática
0 180
Programación Paralela Avanzada
Máster Universitario en Computación de Altas Prestaciones / High Performance Computing
0 10
Trabajo Fin de Grado. Mención en Ingeniería de Computadores
Grado en Ingeniería Informática
0 8
Asignatura y estudios en la que se imparte Horas a distancia Horas totales
Concurrencia y Paralelismo
Grado en Ingeniería Informática
0 85
Estructura de Computadores
Grado en Ingeniería Informática
Grado en Ingeniería Informática. Curso Puente
Máster Universitario en Ingeniería Informática
Máster Universitario en Ingeniería Informática
0 129
Programación Paralela Avanzada
Máster Universitario en Computación de Altas Prestaciones / High Performance Computing
6 16
Asignatura y estudios en la que se imparte Horas a distancia Horas totales
Concurrencia y Paralelismo
Grado en Ingeniería Informática
0 75
Estructura de Computadores
Grado en Ingeniería Informática
Grado en Ingeniería Informática. Curso Puente
Máster Universitario en Ingeniería Informática
0 61
Fundamentos de Computadores
Grado en Ciencia e Ingeniería de Datos
0 45
Programación Paralela Avanzada
Máster Universitario en Computación de Altas Prestaciones / High Performance Computing
6 16
Asignatura y estudios en la que se imparte Horas a distancia Horas totales
Concurrencia y Paralelismo
Grado en Ingeniería Informática
0 75
Estructura de Computadores
Grado en Ingeniería Informática
Grado en Ingeniería Informática. Curso Puente
Máster Universitario en Ingeniería Informática
0 83
Fundamentos de Computadores
Grado en Ciencia e Ingeniería de Datos
0 45
Programación Paralela Avanzada
Máster Universitario en Computación de Altas Prestaciones / High Performance Computing
0 10

Tutorías definidas por el/la docente para el curso académico 2023/2024.

Facultad de Informática

Cuatrimestre Día Lugar
Primer cuatrimestre lunes
18:00 a 20:00
D3.10 Área Científica
Primer cuatrimestre jueves
11:30 a 13:30
D3.10 Área Científica
Primer cuatrimestre jueves
18:00 a 20:00
D3.10 Área Científica
Segundo cuatrimestre lunes
11:30 a 13:30
D3.10 Área Científica
Segundo cuatrimestre miércoles
10:30 a 12:30
D3.10 Área Científica
Segundo cuatrimestre viernes
17:30 a 19:30
D3.10 Área Científica

Resultados de investigación

Puede consultar los méritos de investigación seleccionando un tipo de mérito y el año.

Arquitecturas, Frameworks y Aplicaciones de la Computación de Altas Prestaciones

Entidad financiadora Ministerio de Ciencia e Innovación
Investigadores principales TOURIÑO DOMÍNGUEZ JUAN (IP1) / RODRIGUEZ ÁLVAREZ GABRIEL (IP2)
Tipo Proyecto Programas Nacionales
Fechas Desde 01/09/2023 a 31/08/2026

AXUDAS PARA A CONSOLIDACIÓN E ESTRUTURACIÓN DE UNIDADES DE INVESTIGACIÓN COMPETITIVAS.GRC 2021

Entidad financiadora Consellería de Cultura, Educación e Ordenación Universitaria
Investigadores principales Juan Touriño Domínguez
Tipo Proyecto Programas Autonomicos
Fechas Desde 01/01/2021 a 20/11/2024

Desafíos Actuales en HPC: Arquitecturas, Software y Aplicaciones

Entidad financiadora Ministerio de Ciencia e Innovación
Investigadores principales Touriño Dominguez, Juan e Doallo Biempica, Ramón
Tipo Proyecto Programas Nacionales
Fechas Desde 01/06/2020 a 31/05/2023

NUEVOS DESAFIOS EN COMPUTACION DE ALTAS PRESTACIONES: DESDE ARQUITECTURAS HASTA APLICACIONES (II)

Entidad financiadora Ministerio de Economía y Competitividad (MINECO)
Investigadores principales Ramón Doallo Biempica, Juan Touriño Domínguez
Tipo Proyecto Programas Nacionales
Fechas Desde 30/12/2016 a 29/12/2019

High-Performance Embedded Architectures and Compilation Network of Excellence, HiPEAC-3 NoE

Entidad financiadora Union Europea
Investigadores principales Koen De Bosschere
Tipo Proyecto UE
Fechas Desde 01/02/2012 a 31/01/2016

Arquitecturas, Sistemas y Herramientas para Computación de Altas Prestaciones

Entidad financiadora Ministerio de Economía y Competitividad
Investigadores principales Ramón Doallo Biempica
Tipo Proyecto Programas Nacionales
Fechas Desde 01/01/2011 a 30/06/2014

Contrato Específico de Encargo y Financiación del Proyecto de Investigación HPC4HPT: High Performance Computing for High Performance Trading

Entidad financiadora FUNDACIÓN PEDRO BARRIÉ DE LA MAZA
Investigadores principales Ramón Doallo Biempica, Juan Touriño Domínguez y Guillermo López Taboada
Tipo Contrato
Fechas Desde 22/07/2011 a 31/03/2015

Red Gallega de Bioinformática

Entidad financiadora Xunta de Galicia
Investigadores principales David Posada González
Tipo Proyecto Programas Autonomicos
Fechas Desde 01/01/2010 a 31/12/2011

Red Gallega de Computación de Altas Prestaciones II

Entidad financiadora Xunta de Galicia
Investigadores principales Ramón Doallo Biempica
Tipo Proyecto Programas Autonomicos
Fechas Desde 01/01/2010 a 31/12/2011

Aplicaciones filogenéticas y funcionales de los modelos de evolución molecular y análisis genómico

Entidad financiadora Ministerio de Ciencia e Innovación
Investigadores principales Dr. David Posada González
Tipo Proyecto Programas Nacionales
Fechas Desde 01/01/2010 a 31/12/2012

High-Performance Embedded Architectures and Compilers Network of Excellence (HiPEAC-2 NoE)

Entidad financiadora Union Europea
Investigadores principales Koen De Bosschere
Tipo Proyecto UE
Fechas Desde 01/02/2008 a 31/01/2012

Models of Genome Evolution, Phylogenomics and the Tree of Life

Entidad financiadora European Research Council (ERC)
Investigadores principales Dr. David Posada González
Tipo Proyecto Internacional
Fechas Desde 01/10/2008 a 30/09/2013

The Wall Lizards of the Balkan Peninsula: Tackling Questions at the Interphase of Phylogenomics and Population Genomics

Autores Nikolaos Psonis, Aglaia Antoniou, Emmanouela Kamareta, Diego Darriba, Alexandros Stamatakis, Petros Lymberakis, Nikos Poulakakis
Revista Molecular Phylogenetics and Evolution Vol. 159 Núm. 107121 (págs. 1 a 12)

ModelTest-NG: A New and Scalable Tool for the Selection of DNA and Protein Evolutionary Models

Autores Diego Darriba, David Posada González, Alexey Kozlov, Alexandros Stamatakis, Benoit Morel, Tomas Flouri
Revista MOLECULAR BIOLOGY AND EVOLUTION Vol. 37 Núm. 1 (págs. 291 a 294)

EPA-ng: Massively Parallel Evolutionary Placement of Genetic Sequences

Autores Pierre Barbera, Alexey Kozlov, Lucas Czech, Benoit Morel, Diego Darriba, Tomas Flouri, Alexandros Stamatakis
Revista SYSTEMATIC BIOLOGY Vol. 68 Núm. 2 (págs. 365 a 369)
DOI https://doi.org/10.1093/sysbio/syy054

RAxML-NG: a fast, scalable and user-friendly tool for maximum likelihood phylogenetic inference

Autores Alexey Kozlov, Diego Darriba, Tomas Flouri, Benoit Morel, Alexandros Stamatakis
Revista BIOINFORMATICS Vol. 35 Núm. 21 (págs. 4453 a 4455)

Resolving complex phylogeographic patterns in the Balkan Peninsula using closely related wall-lizard species as a model system

Autores Nikolaos Psonis, Aglaia Antoniou, Emmanouela Kamareta, Adam Leachée, Panayiota Kotsakiozi, Diego Darriba, Alexey Kozlov, Alexandros Stamatakis, Dimitris Poursanidis, Oleg Kukushkin, Daniel Jablonski, Jelka Crnobrnja¿Isailovi¿, Iulian Gherghel, Petros Lymberakisa, Nikos Poulakakis
Revista Molecular Phylogenetics and Evolution Vol. 125 (págs. 100 a 115)
DOI https://doi.org/10.1016/j.ympev.2018.03.021

The State of Software for Evolutionary Biology

Autores Diego Darriba, Tomas Flouri, Alexandros Stamatakis
Revista MOLECULAR BIOLOGY AND EVOLUTION Vol. 35 Núm. 5 (págs. 1037 a 1046)
DOI https://doi.org/10.1093/molbev/msy014

Prediction of Missing Sequences and Branch Lengths in Phylogenetic Data

Autores Diego Darriba, Michael Weiss, Alexandros Stamatakis
Revista BIOINFORMATICS Vol. 32 Núm. 9 (págs. 1331 a 1337)
DOI https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btv768

Does the Choice of Nucleotide Substitution Models Matter Topologically?

Autores Michael Hoff, Sebastian Orf, Benedikt Riehm, Diego Darriba, Alexandros Stamatakis
Revista BMC BIOINFORMATICS Vol. 17 Núm. 1 (págs. 1 a 13)
DOI https://doi.org/10.1186/s12859-016-0985-x

Adapting Reproducible Research Capabilities to Resilient Distributed Calculations

Autores Manuel Rodríguez-Pascual, Christos Kanellopoulos, Antonio Juan Rubio-Montero, Diego Darriba, Ognjen Prnjat, David Posada González, Rafael Mayo-García
Revista International Journal of Grid and High Performance Computing Vol. 8 Núm. 1 (págs. 58 a 69)
DOI https://doi.org/10.4018/ijghpc.2016010105

The Phylogenetic Likelihood Library

Autores Tomas Flouri, Fernando Izquierdo-Carrasco, Diego Darriba, LT Nguyen, Bui Quang Minh, Arndt von Haeseler, Alexandros Stamatakis
Revista SYSTEMATIC BIOLOGY Vol. 64 Núm. 2 (págs. 356 a 362)
DOI https://doi.org/10.1093/sysbio/syu084

jmodeltest.org: Selection of Nucleotide Substitution Models on the Cloud.

Autores Jose Manuel Santorum , Guillermo López Taboada, Diego Darriba, David Posada
Revista BIOINFORMATICS Vol. 30 Núm. 9 (págs. 1310 a 1311)
DOI https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btu032

High-Performance Computing Selection of Models of DNA Substitution for Multicore Clusters.

Autores Diego Darriba, Guillermo López Taboada, Ramón Doallo, David Posada
Revista INTERNATIONAL JOURNAL OF HIGH PERFORMANCE COMPUTING APPLICATIONS Vol. 28 Núm. 1 (págs. 112 a 125)

jModelTest2: More Models, New Heuristics and Parallel Computing

Autores Diego Darriba, Guillermo López Taboada, Ramón Doallo, David Posada
Revista Nature Methods Vol. 9 Núm. 8 (págs. 772 a 772)

ProtTest 3: fast selection of best-fit models of protein evolution

Autores Diego Darriba López, Guillermo López Taboada, Ramón Doallo, David Posada
Revista BIOINFORMATICS Vol. 27 Núm. 8 (págs. 1164 a 1165)

Massively Parallel Evolutionary Placement of Genetic Sequences
ISC 2017 PhD Symposium
Internacional

Autores Pierre Barbera, Alexey Kozlov, Tomas Flouri, Diego Darriba, Lucas Czech, Alexandros Stamatakis
Lugar Frankfurt (Alemania)

A Fault Tolerant Workflow for Reproducible Research
Annual Global Online Conference on Information and Computer Technology (GOCICT 2014)
Internacional

Autores Manuel Rodríguez-Pascual, Antonio Juan Rubio-Montero, Rafael Mayo-García, Christos Kanellopoulos, Ognjen Prnjat, Diego Darriba, David Posada González
Lugar Louisville (Estados Unidos)
DOI https://doi.org/10.1109/gocict.2014.10

Boosting the Performance of Bayesian Divergence Time Estimation with the Phylogenetic Likelihood Library
12th IEEE International Workshop on High Performance Computational Biology (HiCOMB 2013)
Internacional

Autores Diego Darriba, Andre Aberer, Tomas Flouri, Tracy Heath, Fernando Izquierdo-Carrasco, Alexandros Stamatakis
Lugar Boston (Estados Unidos)
DOI https://doi.org/10.1109/ipdpsw.2013.267

Cargos

Cargos académicos o de gestión para el/la docente.

Junta de la Facultad de Informática

PDI (Miembros Natos)

Desde 15/03/2023.

Consejo del Departamento Ingeniería de Computadores

PDI (Miembros Natos)

Desde 15/03/2023.

Junta de la Facultad de Informática

PDI (Miembros Natos)

Desde 22/07/2022 a 14/03/2023.

Consejo del Departamento Ingeniería de Computadores

PDI (Miembros Natos)