Dr. Diego Darriba López  

Profesor contratado doutor (PC-DR)

Departamento Enxeñaría de Computadores
Área Arquitectura e tecnoloxía de computadoras
Investigación  Grupo de investigación Grupo de Arquitectura de Computadores
Liñas de investigación Bioinformática Filoxenética Computación de Altas Prestacións
Contacto Directorio da UDC
Orcid id0000-0001-5482-3932 ResearcherIDN-7273-2019 Scopus37088309000

Docencia

Docencia impartida

Neste apartado móstrase a docencia impartida en graos, másteres e resto de titulacións oficiais ata os últimos 6 anos.

Materia e estudos en que se imparte Horas a distancia Horas totais
Concorrencia e Paralelismo 0 55
Estrutura de Computadores
Grao en Enxeñaría Informática. Curso Ponte
0 105
Programación Paralela Avanzada 0 10
Tecnoloxías de Xestión de Datos 0 26
Traballo Fin de Máster 0 3,5
Materia e estudos en que se imparte Horas a distancia Horas totais
Concorrencia e Paralelismo
Grao en Enxeñaría Informática
0 90
Estrutura de Computadores
Grao en Enxeñaría Informática
Grao en Enxeñaría Informática. Curso Ponte
Máster Universitario en Enxeñaría Informática
0 135
Fundamentos dos Computadores
Grao en Enxeñaría Informática
0 24
Prácticas en Empresa
Máster Universitario en Bioinformática para Ciencias da Saúde
Máster Universitario en Bioinformática para Ciencias da Saúde
0 1
Programación Paralela Avanzada
Máster Universitario en Computación de Altas Prestacións / High Performance Computing
0 10
Traballo Fin de Grao. Mención en Enxeñaría do Software
Grao en Enxeñaría Informática
Grao en Enxeñaría Informática. Curso Ponte
0 2,5
Traballo Fin de Grao. Mención en Tecnoloxías da Información
Grao en Enxeñaría Informática
Grao en Enxeñaría Informática. Curso Ponte
0 5
Traballo Fin de Máster
Máster Universitario en Computación de Altas Prestacións / High Performance Computing
0 1
Materia e estudos en que se imparte Horas a distancia Horas totais
Concorrencia e Paralelismo
Grao en Enxeñaría Informática
0 60
Estrutura de Computadores
Grao en Enxeñaría Informática
Grao en Enxeñaría Informática. Curso Ponte
Máster Universitario en Enxeñaría Informática
0 180
Programación Paralela Avanzada
Máster Universitario en Computación de Altas Prestacións / High Performance Computing
0 10
Traballo Fin de Grao. Mención en Enxeñaría de Computadores
Grao en Enxeñaría Informática
0 8
Materia e estudos en que se imparte Horas a distancia Horas totais
Concorrencia e Paralelismo
Grao en Enxeñaría Informática
0 85
Estrutura de Computadores
Grao en Enxeñaría Informática
Grao en Enxeñaría Informática. Curso Ponte
Máster Universitario en Enxeñaría Informática
Máster Universitario en Enxeñaría Informática
0 129
Programación Paralela Avanzada
Máster Universitario en Computación de Altas Prestacións / High Performance Computing
6 16
Materia e estudos en que se imparte Horas a distancia Horas totais
Concorrencia e Paralelismo
Grao en Enxeñaría Informática
0 75
Estrutura de Computadores
Grao en Enxeñaría Informática
Grao en Enxeñaría Informática. Curso Ponte
Máster Universitario en Enxeñaría Informática
0 61
Fundamentos de Computadores
Grao en Ciencia e Enxeñaría de Datos
0 45
Programación Paralela Avanzada
Máster Universitario en Computación de Altas Prestacións / High Performance Computing
6 16
Materia e estudos en que se imparte Horas a distancia Horas totais
Concorrencia e Paralelismo
Grao en Enxeñaría Informática
0 75
Estrutura de Computadores
Grao en Enxeñaría Informática
Grao en Enxeñaría Informática. Curso Ponte
Máster Universitario en Enxeñaría Informática
0 83
Fundamentos de Computadores
Grao en Ciencia e Enxeñaría de Datos
0 45
Programación Paralela Avanzada
Máster Universitario en Computación de Altas Prestacións / High Performance Computing
0 10

Titorías definidas polo/a docente para o curso académico 2024/2025.

Facultade de Informática

Cuadrimestre Día Lugar
Primeiro cuadrimestre luns
11:30 a 13:30
D3.10 Área Científica
Primeiro cuadrimestre martes
17:00 a 19:00
D3.10 Área Científica
Primeiro cuadrimestre xoves
17:30 a 19:30
D3.10 Área Científica
Segundo cuadrimestre luns
11:30 a 13:30
D3.10 Área Científica
Segundo cuadrimestre mércores
10:30 a 12:30
D3.10 Área Científica
Segundo cuadrimestre venres
17:30 a 19:30
D3.10 Área Científica

Resultados da investigación

Pode consultar os méritos de investigación seleccionando un tipo de mérito e o ano.

Arquitecturas, Frameworks y Aplicaciones de la Computación de Altas Prestaciones

Entidade financiadora Ministerio de Ciencia e Innovación
Investigadores principais TOURIÑO DOMÍNGUEZ JUAN (IP1) / RODRIGUEZ ÁLVAREZ GABRIEL (IP2)
Tipo Proxecto Programas Nacionales
Datas Desde 01/09/2023 ata 31/08/2026

AXUDAS PARA A CONSOLIDACIÓN E ESTRUTURACIÓN DE UNIDADES DE INVESTIGACIÓN COMPETITIVAS.GRC 2021

Entidade financiadora Consellería de Cultura, Educación e Ordenación Universitaria
Investigadores principais Juan Touriño Domínguez
Tipo Proxecto Programas Autonomicos
Datas Desde 01/01/2021 ata 20/11/2024

Desafíos Actuales en HPC: Arquitecturas, Software y Aplicaciones

Entidade financiadora Ministerio de Ciencia e Innovación
Investigadores principais Touriño Dominguez, Juan e Doallo Biempica, Ramón
Tipo Proxecto Programas Nacionales
Datas Desde 01/06/2020 ata 31/05/2023

NUEVOS DESAFIOS EN COMPUTACION DE ALTAS PRESTACIONES: DESDE ARQUITECTURAS HASTA APLICACIONES (II)

Entidade financiadora Ministerio de Economía y Competitividad (MINECO)
Investigadores principais Ramón Doallo Biempica, Juan Touriño Domínguez
Tipo Proxecto Programas Nacionales
Datas Desde 30/12/2016 ata 29/12/2019

High-Performance Embedded Architectures and Compilation Network of Excellence, HiPEAC-3 NoE

Entidade financiadora Union Europea
Investigadores principais Koen De Bosschere
Tipo Proxecto UE
Datas Desde 01/02/2012 ata 31/01/2016

Arquitecturas, Sistemas y Herramientas para Computación de Altas Prestaciones

Entidade financiadora Ministerio de Economía y Competitividad
Investigadores principais Ramón Doallo Biempica
Tipo Proxecto Programas Nacionales
Datas Desde 01/01/2011 ata 30/06/2014

Contrato Específico de Encargo y Financiación del Proyecto de Investigación HPC4HPT: High Performance Computing for High Performance Trading

Entidade financiadora FUNDACIÓN PEDRO BARRIÉ DE LA MAZA
Investigadores principais Ramón Doallo Biempica, Juan Touriño Domínguez y Guillermo López Taboada
Tipo Contrato
Datas Desde 22/07/2011 ata 31/03/2015

Red Gallega de Bioinformática

Entidade financiadora Xunta de Galicia
Investigadores principais David Posada González
Tipo Proxecto Programas Autonomicos
Datas Desde 01/01/2010 ata 31/12/2011

Red Gallega de Computación de Altas Prestaciones II

Entidade financiadora Xunta de Galicia
Investigadores principais Ramón Doallo Biempica
Tipo Proxecto Programas Autonomicos
Datas Desde 01/01/2010 ata 31/12/2011

Aplicaciones filogenéticas y funcionales de los modelos de evolución molecular y análisis genómico

Entidade financiadora Ministerio de Ciencia e Innovación
Investigadores principais Dr. David Posada González
Tipo Proxecto Programas Nacionales
Datas Desde 01/01/2010 ata 31/12/2012

High-Performance Embedded Architectures and Compilers Network of Excellence (HiPEAC-2 NoE)

Entidade financiadora Union Europea
Investigadores principais Koen De Bosschere
Tipo Proxecto UE
Datas Desde 01/02/2008 ata 31/01/2012

Models of Genome Evolution, Phylogenomics and the Tree of Life

Entidade financiadora European Research Council (ERC)
Investigadores principais Dr. David Posada González
Tipo Proxecto Internacional
Datas Desde 01/10/2008 ata 30/09/2013

The Wall Lizards of the Balkan Peninsula: Tackling Questions at the Interphase of Phylogenomics and Population Genomics

Autores Nikolaos Psonis, Aglaia Antoniou, Emmanouela Kamareta, Diego Darriba, Alexandros Stamatakis, Petros Lymberakis, Nikos Poulakakis
Revista Molecular Phylogenetics and Evolution Vol. 159 Núm. 107121 (páxs. 1 ata 12)

ModelTest-NG: A New and Scalable Tool for the Selection of DNA and Protein Evolutionary Models

Autores Diego Darriba, David Posada González, Alexey Kozlov, Alexandros Stamatakis, Benoit Morel, Tomas Flouri
Revista MOLECULAR BIOLOGY AND EVOLUTION Vol. 37 Núm. 1 (páxs. 291 ata 294)

EPA-ng: Massively Parallel Evolutionary Placement of Genetic Sequences

Autores Pierre Barbera, Alexey Kozlov, Lucas Czech, Benoit Morel, Diego Darriba, Tomas Flouri, Alexandros Stamatakis
Revista SYSTEMATIC BIOLOGY Vol. 68 Núm. 2 (páxs. 365 ata 369)
DOI https://doi.org/10.1093/sysbio/syy054

RAxML-NG: a fast, scalable and user-friendly tool for maximum likelihood phylogenetic inference

Autores Alexey Kozlov, Diego Darriba, Tomas Flouri, Benoit Morel, Alexandros Stamatakis
Revista BIOINFORMATICS Vol. 35 Núm. 21 (páxs. 4453 ata 4455)

Resolving complex phylogeographic patterns in the Balkan Peninsula using closely related wall-lizard species as a model system

Autores Nikolaos Psonis, Aglaia Antoniou, Emmanouela Kamareta, Adam Leachée, Panayiota Kotsakiozi, Diego Darriba, Alexey Kozlov, Alexandros Stamatakis, Dimitris Poursanidis, Oleg Kukushkin, Daniel Jablonski, Jelka Crnobrnja¿Isailovi¿, Iulian Gherghel, Petros Lymberakisa, Nikos Poulakakis
Revista Molecular Phylogenetics and Evolution Vol. 125 (páxs. 100 ata 115)
DOI https://doi.org/10.1016/j.ympev.2018.03.021

The State of Software for Evolutionary Biology

Autores Diego Darriba, Tomas Flouri, Alexandros Stamatakis
Revista MOLECULAR BIOLOGY AND EVOLUTION Vol. 35 Núm. 5 (páxs. 1037 ata 1046)
DOI https://doi.org/10.1093/molbev/msy014

Prediction of Missing Sequences and Branch Lengths in Phylogenetic Data

Autores Diego Darriba, Michael Weiss, Alexandros Stamatakis
Revista BIOINFORMATICS Vol. 32 Núm. 9 (páxs. 1331 ata 1337)
DOI https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btv768

Does the Choice of Nucleotide Substitution Models Matter Topologically?

Autores Michael Hoff, Sebastian Orf, Benedikt Riehm, Diego Darriba, Alexandros Stamatakis
Revista BMC BIOINFORMATICS Vol. 17 Núm. 1 (páxs. 1 ata 13)
DOI https://doi.org/10.1186/s12859-016-0985-x

Adapting Reproducible Research Capabilities to Resilient Distributed Calculations

Autores Manuel Rodríguez-Pascual, Christos Kanellopoulos, Antonio Juan Rubio-Montero, Diego Darriba, Ognjen Prnjat, David Posada González, Rafael Mayo-García
Revista International Journal of Grid and High Performance Computing Vol. 8 Núm. 1 (páxs. 58 ata 69)
DOI https://doi.org/10.4018/ijghpc.2016010105

The Phylogenetic Likelihood Library

Autores Tomas Flouri, Fernando Izquierdo-Carrasco, Diego Darriba, LT Nguyen, Bui Quang Minh, Arndt von Haeseler, Alexandros Stamatakis
Revista SYSTEMATIC BIOLOGY Vol. 64 Núm. 2 (páxs. 356 ata 362)
DOI https://doi.org/10.1093/sysbio/syu084

jmodeltest.org: Selection of Nucleotide Substitution Models on the Cloud.

Autores Jose Manuel Santorum , Guillermo López Taboada, Diego Darriba, David Posada
Revista BIOINFORMATICS Vol. 30 Núm. 9 (páxs. 1310 ata 1311)
DOI https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btu032

High-Performance Computing Selection of Models of DNA Substitution for Multicore Clusters.

Autores Diego Darriba, Guillermo López Taboada, Ramón Doallo, David Posada
Revista INTERNATIONAL JOURNAL OF HIGH PERFORMANCE COMPUTING APPLICATIONS Vol. 28 Núm. 1 (páxs. 112 ata 125)

jModelTest2: More Models, New Heuristics and Parallel Computing

Autores Diego Darriba, Guillermo López Taboada, Ramón Doallo, David Posada
Revista Nature Methods Vol. 9 Núm. 8 (páxs. 772 ata 772)

ProtTest 3: fast selection of best-fit models of protein evolution

Autores Diego Darriba López, Guillermo López Taboada, Ramón Doallo, David Posada
Revista BIOINFORMATICS Vol. 27 Núm. 8 (páxs. 1164 ata 1165)

Massively Parallel Evolutionary Placement of Genetic Sequences
ISC 2017 PhD Symposium
Internacional

Autores Pierre Barbera, Alexey Kozlov, Tomas Flouri, Diego Darriba, Lucas Czech, Alexandros Stamatakis
Lugar Frankfurt (Alemania)

A Fault Tolerant Workflow for Reproducible Research
Annual Global Online Conference on Information and Computer Technology (GOCICT 2014)
Internacional

Autores Manuel Rodríguez-Pascual, Antonio Juan Rubio-Montero, Rafael Mayo-García, Christos Kanellopoulos, Ognjen Prnjat, Diego Darriba, David Posada González
Lugar Louisville (Estados Unidos)
DOI https://doi.org/10.1109/gocict.2014.10

Boosting the Performance of Bayesian Divergence Time Estimation with the Phylogenetic Likelihood Library
12th IEEE International Workshop on High Performance Computational Biology (HiCOMB 2013)
Internacional

Autores Diego Darriba, Andre Aberer, Tomas Flouri, Tracy Heath, Fernando Izquierdo-Carrasco, Alexandros Stamatakis
Lugar Boston (Estados Unidos)
DOI https://doi.org/10.1109/ipdpsw.2013.267

Cargos

Cargos académicos ou de xestión para o/a docente.

Xunta da Facultade de Informática

PDI (Membros Natos)

Desde 15/03/2023.

Consello do Departamento Enxeñaría de Computadores

PDI (Membros Natos)

Desde 15/03/2023.

Xunta da Facultade de Informática

PDI (Membros Natos)

Desde 22/07/2022 ata 14/03/2023.

Consello do Departamento Enxeñaría de Computadores

PDI (Membros Natos)