| Departamento | Ingeniería de Computadores |
| Área | Arquitectura y tecnología de computadore |
| Investigación | Grupo de investigación Grupo de Arquitectura de Ordenadores |
| Líneas de investigación | No figuran en el gestor curricular de la UDC (SUXI). |
| Evaluación de méritos docentes | 2 quinquenio(s) |
| Evaluación de méritos de investigación | 2 sexenio(s) |
| Contacto | Directorio de la UDC |
| Orcid id0000-0002-2602-4874 ResearcherIDH-7371-2016 Scopus35113258100 | |
En este apartado se muestra la docencia impartida en grados, másteres y resto de estudios oficiales en los últimos 6 años.
| Asignatura y estudios en la que se imparte | Carácter | Horas a distancia | Horas totales |
|---|---|---|---|
| Aplicaciones y Tendencias en Bioinformática e Ingeniería Biomédica | Optativo | 0 | 8,5 |
| Computación de Altas Prestaciones en Bioinformática | Obligatorio | 0 | 42 |
| Concurrencia y Paralelismo | Obligatorio | 0 | 20 |
| Prácticas Profesionales | Obligatorio | 0 | 2 |
| Procesamiento Paralelo Avanzado | Optativo | 0 | 14 |
| Programación de Arquitecturas Heterogéneas | Obligatorio | 8 | 24 |
| Trabajo Fin de Grado. Mención en Computación | Obligatorio | 0 | 6,5 |
| Trabajo Fin de Máster | Obligatorio | 0 | 44,33 |
| Trabajo Fin de Máster | Obligatorio | 0 | 12,66 |
| Asignatura y estudios en la que se imparte | Carácter | Horas a distancia | Horas totales |
|---|---|---|---|
|
Aplicaciones y Tendencias en Bioinformática e Ingeniería Biomédica
Máster Universitario en Bioinformática para Ciencias de la Salud
|
Optativo | 0 | 8,5 |
|
Computación de Altas Prestaciones en Bioinformática
Máster Universitario en Bioinformática para Ciencias de la Salud
|
Obligatorio | 0 | 41 |
|
Concurrencia y Paralelismo
Grado en Ingeniería Informática
|
Obligatorio | 0 | 40 |
|
Prácticas Profesionales
Máster Universitario en Computación de Altas Prestaciones / High Performance Computing
|
Obligatorio | 0 | 2 |
|
Procesamiento Paralelo Avanzado
Grado en Ciencia e Ingeniería de Datos
|
Optativo | 0 | 14 |
|
Programación de Arquitecturas Heterogéneas
Máster Universitario en Computación de Altas Prestaciones / High Performance Computing
|
Obligatorio | 8 | 24 |
|
Trabajo Fin de Grado. Mención en Computación
Grado en Ingeniería Informática
|
Obligatorio | 0 | 4 |
|
Trabajo Fin de Máster
Máster Universitario en Computación de Altas Prestaciones / High Performance Computing
|
Obligatorio | 0 | 56,5 |
| Asignatura y estudios en la que se imparte | Carácter | Horas a distancia | Horas totales |
|---|---|---|---|
|
Aplicaciones y Tendencias en Bioinformática e Ingeniería Biomédica
Máster Universitario en Bioinformática para Ciencias de la Salud
|
Optativo | 0 | 8,5 |
|
Computación de Altas Prestaciones en Bioinformática
Máster Universitario en Bioinformática para Ciencias de la Salud
|
Obligatorio | 0 | 41 |
|
Concurrencia y Paralelismo
Grado en Ingeniería Informática
|
Obligatorio | 0 | 80 |
|
Procesamiento Paralelo Avanzado
Grado en Ciencia e Ingeniería de Datos
|
Optativo | 0 | 14 |
|
Programación de Arquitecturas Heterogéneas
Máster Universitario en Computación de Altas Prestaciones / High Performance Computing
|
Obligatorio | 8 | 22 |
|
Trabajo Fin de Grado. Mención en Computación
Grado en Ingeniería Informática
|
Obligatorio | 0 | 4 |
|
Trabajo Fin de Grado. Mención en Ingeniería de Computadores
Grado en Ingeniería Informática
|
Obligatorio | 0 | 4 |
|
Trabajo Fin de Grado. Mención en Tecnologías de la Información
Grado en Ingeniería Informática
Grado en Ingeniería Informática. Curso Puente
|
Obligatorio | 0 | 4 |
|
Trabajo Fin de Máster
Máster Universitario en Computación de Altas Prestaciones / High Performance Computing
|
Obligatorio | 0 | 15 |
| Asignatura y estudios en la que se imparte | Carácter | Horas a distancia | Horas totales |
|---|---|---|---|
|
Aplicaciones y Tendencias en Bioinformática e Ingeniería Biomédica
Máster Universitario en Bioinformática para Ciencias de la Salud
|
Optativo | 0 | 8,5 |
|
Computación de Altas Prestaciones en Bioinformática
Máster Universitario en Bioinformática para Ciencias de la Salud
|
Obligatorio | 0 | 42 |
|
Concurrencia y Paralelismo
Grado en Ingeniería Informática
|
Obligatorio | 0 | 50 |
|
Prácticas en Empresa
Máster Universitario en Bioinformática para Ciencias de la Salud
Máster Universitario en Bioinformática para Ciencias de la Salud
|
Optativo | 0 | 0,5 |
|
Programación de Arquitecturas Heterogéneas
Máster Universitario en Computación de Altas Prestaciones / High Performance Computing
|
Obligatorio | 16 | 30 |
|
Trabajo Fin de Grado. Mención en Computación
Grado en Ingeniería Informática
|
Obligatorio | 0 | 4 |
|
Trabajo Fin de Máster
Máster Universitario en Computación de Altas Prestaciones / High Performance Computing
|
Obligatorio | 0 | 20 |
| Asignatura y estudios en la que se imparte | Carácter | Horas a distancia | Horas totales |
|---|---|---|---|
|
Aplicaciones y Tendencias en Bioinformática e Ingeniería Biomédica
Máster Universitario en Bioinformática para Ciencias de la Salud
|
Optativo | 0 | 8,5 |
|
Computación de Altas Prestaciones en Bioinformática
Máster Universitario en Bioinformática para Ciencias de la Salud
|
Obligatorio | 0 | 42 |
|
Programación de Arquitecturas Heterogéneas
Máster Universitario en Computación de Altas Prestaciones / High Performance Computing
|
Obligatorio | 16 | 30 |
|
Trabajo Fin de Grado. Mención en Ingeniería del Software
Grado en Ingeniería Informática
Grado en Ingeniería Informática. Curso Puente
|
Obligatorio | 0 | 4 |
|
Trabajo Fin de Máster
Máster Universitario en Computación de Altas Prestaciones / High Performance Computing
|
Obligatorio | 0 | 5 |
| Asignatura y estudios en la que se imparte | Carácter | Horas a distancia | Horas totales |
|---|---|---|---|
|
Aplicaciones y Tendencias en Bioinformática e Ingeniería Biomédica
Máster Universitario en Bioinformática para Ciencias de la Salud
|
Optativo | 0 | 8,5 |
|
Arquitectura de Computadores
Grado en Ingeniería Informática
|
Optativo | 0 | 3 |
|
Computación de Altas Prestaciones en Bioinformática
Máster Universitario en Bioinformática para Ciencias de la Salud
|
Obligatorio | 0 | 42 |
|
Concurrencia y Paralelismo
Grado en Ingeniería Informática
|
Obligatorio | 0 | 90 |
|
Programación de Arquitecturas Heterogéneas
Máster Universitario en Computación de Altas Prestaciones / High Performance Computing
|
Obligatorio | 0 | 14 |
|
Trabajo Fin de Grado. Mención en Ingeniería de Computadores
Grado en Ingeniería Informática
|
Obligatorio | 0 | 4 |
|
Trabajo Fin de Grado. Mención en Tecnologías de la Información
Grado en Ingeniería Informática
Grado en Ingeniería Informática. Curso Puente
|
Obligatorio | 0 | 4 |
|
Trabajo Fin de Máster
Máster Universitario en Bioinformática para Ciencias de la Salud
|
Obligatorio | 0 | 20 |
Tutorías definidas por el/la docente para el curso académico 2024/2025.
| Cuatrimestre | Día | Lugar |
|---|---|---|
| Primer cuatrimestre |
martes
10:30 a 12:30 |
D. 3.08 Área Científica |
| Primer cuatrimestre |
miércoles
10:30 a 12:30 |
D. 3.08 Área Científica |
| Primer cuatrimestre |
jueves
10:30 a 12:30 |
D. 3.08 Área Científica |
| Segundo cuatrimestre |
lunes
12:30 a 14:30 |
D 3.08 (Área Científica) |
| Segundo cuatrimestre |
miércoles
12:30 a 14:30 |
D 3.08 (Área Científica) |
| Segundo cuatrimestre |
jueves
10:30 a 12:30 |
D 3.08 (Área Científica) |
| Segunda oportunidad |
martes
10:30 a 12:30 |
D 3.08 (Área Científica) |
| Segunda oportunidad |
miércoles
10:30 a 12:30 |
D 3.08 (Área Científica) |
| Segunda oportunidad |
jueves
10:30 a 12:30 |
D 3.08 (Área Científica) |
Dirigidos o codirigidos por el/la docente desde el año 2013.
| ¿Es posible predecir el precio de las acciones con Aprendizaje Profundo? |
| Aceleración de un método de identificación de regiones con metilación específicade alelos en clústers de sistemas multinúcleo |
| Análisis del algoritmo del Bandido Multi-Armado para un caso de distribución de cálculo en un entorno IOT |
| Construcción en paralelo de bases de datos para la predicción de interacciones de ARN |
| Convolución 3D en paralelo |
| Desarrollo de algoritmos paralelos de 'Búsqueda del Vecino más Lejano' |
| Desarrollo de un método paralelo de descubrimiento de repeticiones largas en tándem para sistemas de memoria distribuida |
| Estudio comparativo de análisis de datos hecho entre python y Power Query para integración en Power Bi |
| Extracción y estructuración de información a partir de CVs |
| Montaje de un cluster de pruebas reutilizando recursos HPC |
| Predicción de un partido de fútbol y los goles esperados |
| Visión y aprendizaje dinámico aplicado al censo de animales salvajes |
| Aceleración de un algoritmo de selección de características en GPUs |
| Aceleración de un método de selección de características online en entornos Big Data |
| Clasificación automática de informes de clientes mediante Procesamiento de Lenguaje Natural |
| Paralelización del entrenamiento de redes neuronales profundas de procesamiento de lenguaje natural sobre plataformas distribuidas con procesadores multinúcleo y GPUs |
| pRIblast: una aplicación paralela de alta eficiencia para la predicción de interacciones ARN- ARN |
| Una herramienta paralela para la identificación de regiones diferencialmente metiladas en análisis genómicos |
| Desarrollo de una herramienta para el control de calidad de secuencias genéticas en entornos BigData |
| Paralelización de ARACNe, un algoritmo para la reconstrucción de redes de regulación genética. |
Puede consultar los méritos de investigación seleccionando un tipo de mérito y el año.
Arquitecturas, Frameworks y Aplicaciones de la Computación de Altas Prestaciones
| Entidad financiadora | Ministerio de Ciencia e Innovación |
| Investigadores principales | TOURIÑO DOMÍNGUEZ JUAN (IP1) / RODRIGUEZ ÁLVAREZ GABRIEL (IP2) |
| Tipo | Proyecto Programas Nacionales |
| Fechas | Desde 01/09/2023 a 31/08/2026 |
Algoritmos de selección de características verdes y rápidos
| Entidad financiadora | Ministerio de Ciencia e Innovación |
| Investigadores principales | Verónica Bolón Canedo |
| Tipo | Proyecto Programas Nacionales |
| Fechas | Desde 01/12/2022 a 30/11/2024 |
AXUDAS PARA A CONSOLIDACIÓN E ESTRUTURACIÓN DE UNIDADES DE INVESTIGACIÓN COMPETITIVAS.GRC 2021
| Entidad financiadora | Consellería de Cultura, Educación e Ordenación Universitaria |
| Investigadores principales | Juan Touriño Domínguez |
| Tipo | Proyecto Programas Autonomicos |
| Fechas | Desde 01/01/2021 a 20/11/2024 |
Desafíos Actuales en HPC: Arquitecturas, Software y Aplicaciones
| Entidad financiadora | Ministerio de Ciencia e Innovación |
| Investigadores principales | Touriño Dominguez, Juan e Doallo Biempica, Ramón |
| Tipo | Proyecto Programas Nacionales |
| Fechas | Desde 01/06/2020 a 31/05/2023 |
Optimización de métodos de selección de características basados en información mutua para arquitecturas hardware no convencionales (SC-IM-HW)
| Entidad financiadora | Centro de Investigación en Tecnoloxías da Información e as Comunicacións (CITIC) |
| Investigadores principales | Jorge González Domínguez |
| Tipo | Proyecto Otros Programas |
| Fechas | Desde 01/07/2018 a 30/09/2019 |
Axudas para a consolidación e estruturación de unidades de investigación competitivas-REDES. Red de Tecnologías Cloud y Big Data para HPC (II)
| Entidad financiadora | Consellería de Cultura, Educación e Ordenación Universitaria |
| Investigadores principales | JUAN TOURIÑO DOMÍNGUEZ |
| Tipo | Proyecto Programas Autonomicos |
| Fechas | Desde 01/01/2017 a 31/12/2018 |
Red de Computación de Altas Prestaciones en Arquitecturas Heterogéneas (CAPAP-H6)
| Entidad financiadora | Ministerio de Economía y Competitividad |
| Investigadores principales | Diego R. Llanos Ferraris |
| Tipo | Proyecto Programas Nacionales |
| Fechas | Desde 01/07/2017 a 30/06/2019 |
Consolidación y Estructuración de Unidades de Investigación Competitivas: Grupo de Arquitectura de Computadores de la Universidad de A Coruña
| Entidad financiadora | Consellería de Cultura, Educación e Ordenación Universitaria |
| Investigadores principales | Juan Touriño Domínguez |
| Tipo | Proyecto Programas Autonomicos |
| Fechas | Desde 25/10/2017 a 31/12/2020 |
High Performance and Embedded Architecture and Compilation, HiPEAC-5
| Entidad financiadora | Union Europea |
| Investigadores principales | Koen De Bosschere |
| Tipo | Proyecto UE |
| Fechas | Desde 01/12/2017 a 29/02/2020 |
High-Performance and Embedded Architecture and Compilation, HiPEAC-4
| Entidad financiadora | Union Europea |
| Investigadores principales | Koen De Bosschere |
| Tipo | Proyecto UE |
| Fechas | Desde 01/01/2016 a 28/02/2018 |
Axudas para a acreditación, estruturación e mellora de centros de investigación singulares e agrupacións estratéxicas consolidadas do Sistema universitario de Galicia, cofinanciadas polo Fondo Europeo de Desenvolvemento Rexional (Feder), no marco do programa operativo Feder Galicia 2014-2020
| Entidad financiadora | Consellería de Cultura, Educación e Ordenación Universitaria |
| Investigadores principales | Manuel F. González Penedo |
| Tipo | Proyecto Programas Autonomicos |
| Fechas | Desde 01/01/2016 a 30/11/2019 |
NUEVOS DESAFIOS EN COMPUTACION DE ALTAS PRESTACIONES: DESDE ARQUITECTURAS HASTA APLICACIONES (II)
| Entidad financiadora | Ministerio de Economía y Competitividad (MINECO) |
| Investigadores principales | Ramón Doallo Biempica, Juan Touriño Domínguez |
| Tipo | Proyecto Programas Nacionales |
| Fechas | Desde 30/12/2016 a 29/12/2019 |
Red de Computación de Altas Prestaciones en Arquitecturas Heterogéneas (CAPAP-H5)
| Entidad financiadora | Ministerio de Economía y Competitividad |
| Investigadores principales | Arturo González Escribano |
| Tipo | Proyecto Programas Nacionales |
| Fechas | Desde 01/01/2015 a 31/12/2015 |
Network for Sustainable Ultrascale Computing (NESUS)
| Entidad financiadora | Union Europea |
| Investigadores principales | Jesús Carretero Pérez |
| Tipo | Proyecto UE |
| Fechas | Desde 28/03/2014 a 27/03/2018 |
Nuevos Desafíos en Computación de Altas Prestaciones: desde Arquitecturas hasta Aplicaciones
| Entidad financiadora | Ministerio de Economía y Competitividad |
| Investigadores principales | Ramón Doallo Biempica y Juan Touriño Domínguez |
| Tipo | Proyecto Programas Nacionales |
| Fechas | Desde 01/01/2014 a 31/12/2017 |
Red de Tecnologías Cloud y Big Data para HPC
| Entidad financiadora | Xunta de Galicia |
| Investigadores principales | Juan Touriño Domínguez |
| Tipo | Proyecto Programas Autonomicos |
| Fechas | Desde 01/01/2014 a 31/12/2015 |
Consolidación y Estructuración de Unidades de Investigación Competitivas: Grupo de Arquitectura de Computadores de la Universidad de A Coruña (Grupo de Referencia Competitiva)
| Entidad financiadora | Xunta de Galicia |
| Investigadores principales | Ramón Doallo Biempica |
| Tipo | Proyecto Programas Autonomicos |
| Fechas | Desde 01/01/2013 a 31/12/2016 |
Ayudas para la consolidación y estructuración de unidades de investigación competitiva. Modalidad de agrupaciones estratégicas (CITIC)
| Entidad financiadora | Xunta de Galicia |
| Investigadores principales | Ricardo Cao Abad |
| Tipo | Proyecto Programas Autonomicos |
| Fechas | Desde 01/01/2012 a 31/12/2013 |
High-Performance Embedded Architectures and Compilation Network of Excellence, HiPEAC-3 NoE
| Entidad financiadora | Union Europea |
| Investigadores principales | Koen De Bosschere |
| Tipo | Proyecto UE |
| Fechas | Desde 01/02/2012 a 31/01/2016 |
Red de Computación de Altas Prestaciones sobre Arquitecturas Paralelas Heterogéneas (CAPAP-H4)
| Entidad financiadora | Ministerio de Economía y Competitividad |
| Investigadores principales | Diego R. Llanos Ferraris |
| Tipo | Proyecto Programas Nacionales |
| Fechas | Desde 15/06/2012 a 25/04/2014 |
Arquitecturas, Sistemas y Herramientas para Computación de Altas Prestaciones
| Entidad financiadora | Ministerio de Economía y Competitividad |
| Investigadores principales | Ramón Doallo Biempica |
| Tipo | Proyecto Programas Nacionales |
| Fechas | Desde 01/01/2011 a 30/06/2014 |
Open European Network for High Performance Computing on Complex Environments (ComplexHPC)
| Entidad financiadora | Union Europea |
| Investigadores principales | Emmanuel Jeannot |
| Tipo | Proyecto UE |
| Fechas | Desde 07/05/2009 a 06/07/2013 |
pRIblast: A parallel application for IncRNA-RNA interaction prediction
| Tipo | Software Registrado |
| Entidad | Universidade da Coruña |
| Autores | Iñaki Amatria-Barral, Jorge González Domínguez, Juan Touriño Domínguez |
| Fecha de solicitud | 31/03/2023 |
| Fecha de concesión | 13/10/2023 |
Parallel-FST: Feature Selection Library for Clusters
| Tipo | Software Registrado |
| Entidad | Universidade da Coruña |
| Autores | Bieito Beceiro Fernández, Jorge González Domínguez, Juan Touriño Domínguez |
| Fecha de solicitud | 05/08/2022 |
| Fecha de concesión | 14/04/2023 |
PyToxo
| Tipo | Software Registrado |
| Entidad | |
| Autores | Christian Ponte, María J. Martín, Borja González-Seoane, Jorge González Domínguez |
| Fecha de solicitud | 06/08/2021 |
| Fecha de concesión | 05/11/2021 |
Cuda joint mututal information. CUDA-JMI
| Tipo | Software Registrado |
| Entidad | UDC |
| Autores | Jorge González Domínguez, Roberto R. Expósito, Verónica Bolón-Canedo |
| Fecha de solicitud | 06/02/2020 |
| Fecha de concesión | 22/12/2020 |
MPI3SNP
| Tipo | Software Registrado |
| Entidad | UDC |
| Autores | María J. Martín, Jorge González Domínguez, Christian Ponte |
| Fecha de solicitud | 30/06/2019 |
ParBiBit
| Tipo | Software Registrado |
| Entidad | Universidade da Coruña (UDC) |
| Autores | Jorge González Domínguez, Roberto Rey Expósito |
| Fecha de solicitud | 07/06/2018 |
| Fecha de concesión | 16/07/2018 |
CUBiBit
| Tipo | Software Registrado |
| Entidad | Universidade da Coruña (UDC) |
| Autores | Jorge González Domínguez, Roberto Rey Expósito |
| Fecha de solicitud | 16/08/2018 |
| Fecha de concesión | 31/10/2018 |
MPICorMat
| Tipo | Software Registrado |
| Entidad | Universidade da Coruña (UDC) |
| Autores | Jorge González Domínguez, María J. Martín |
| Fecha de solicitud | 27/06/2017 |
| Fecha de concesión | 14/08/2017 |
MPIGeneNet
| Tipo | Software Registrado |
| Entidad | Universidade da Coruña (UDC) |
| Autores | Jorge González Domínguez, María J. Martín |
| Fecha de solicitud | 02/11/2017 |
| Fecha de concesión | 14/02/2018 |
MapReduce Duplicate Removal Tool (MarDRe)
| Tipo | Software Registrado |
| Entidad | Universidade da Coruña (UDC) |
| Autores | Roberto Rey Expósito, Jorge Veiga Fachal, Jorge González Domínguez, Juan Touriño Domínguez |
| Fecha de solicitud | 02/11/2017 |
| Fecha de concesión | 14/02/2018 |
Servet Benchmark Suite
| Tipo | Software Registrado |
| Entidad | Universidade da Coruña (UDC) |
| Autores | Jorge González Domínguez, Guillermo López Taboada, Basilio B. Fraguela, María J. Martín, Juan Touriño Domínguez |
| Fecha de solicitud | 07/08/2013 |
| Fecha de concesión | 09/01/2014 |
pRIblast: A Highly Efficient Parallel Application for Comprehensive lncRNA-RNA Interaction Prediction
| Autores | Iñaki Amatria-Barral, Jorge González Domínguez, Juan Touriño Domínguez |
| Revista | FUTURE GENERATION COMPUTER SYSTEMS Vol. 138 (págs. 270 a 279) |
| DOI | https://doi.org/10.1016/j.future.2022.08.014 |
ParRADMeth: Identification of Differentially Methylated Regions on Multicore Clusters
| Autores | Alejandro Fernández-Fraga, Jorge González Domínguez, Juan Touriño Domínguez |
| Revista | IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics Vol. 20 Núm. 3 (págs. 2041 a 2049) |
| DOI | https://doi.org/10.1109/tcbb.2022.3230473 |
MPI-dot2dot: A parallel tool to find DNA tandem repeats on multicore clusters
| Autores | Jorge González Domínguez, José M Martín-Martínez, Roberto Rey Expósito |
| Revista | JOURNAL OF SUPERCOMPUTING Vol. 78 (págs. 4217 a 4235) |
| DOI | https://doi.org/10.1007/s11227-021-04025-7 |
A SIMD Algorithm for the Detection of Epistatic Interactions of any Order
| Autores | Christian Ponte, María J. Martín, Jorge González Domínguez |
| Revista | FUTURE GENERATION COMPUTER SYSTEMS Vol. 132 (págs. 108 a 123) |
| DOI | https://doi.org/10.1016/j.future.2022.02.009 |
Evaluation of Existing Methods for High-Order Epistasis Detection
| Autores | Christian Ponte-Fernández, Jorge González Domínguez, Antonio Carvajal Rodríguez, María J. Martín |
| Revista | IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics Vol. 19 Núm. 2 (págs. 912 a 926) |
| DOI | https://doi.org/10.1109/tcbb.2020.3030312 |
PyToxo: a Python tool for calculating penetrance tables of high-order epistasis models
| Autores | Borja González-Seoane, Christian Ponte-Fernández, Jorge González Domínguez, María J. Martín |
| Revista | BMC BIOINFORMATICS Vol. 23 Núm. 117 |
| DOI | https://doi.org/10.1186/s12859-022-04645-7 |
Parallel-FST: a Feature Selection Library for Multicore Clusters
| Autores | Bieito Beceiro Fernández, Jorge González Domínguez, Juan Touriño Domínguez |
| Revista | JOURNAL OF PARALLEL AND DISTRIBUTED COMPUTING Vol. 169 (págs. 106 a 116) |
| DOI | https://doi.org/10.1016/j.jpdc.2022.06.012 |
Fiuncho: a program for any-order epistasis detection in CPU clusters
| Autores | Christian Ponte-Fernández, Jorge González Domínguez, María J. Martín |
| Revista | JOURNAL OF SUPERCOMPUTING Vol. 78 (págs. 15338 a 15357) |
| DOI | https://doi.org/10.1007/s11227-022-04477-5 |
ScalaParBiBit: scaling the binary biclustering in distributed-memory systems
| Autores | Basilio B. Fraguela, Diego Andrade Canosa, Jorge González Domínguez |
| Revista | Cluster Computing Vol. 24 Núm. 3 (págs. 2249 a 2268) |
| DOI | https://doi.org/10.1007/s10586-021-03261-z |
Fast Search of Third-Order Epistatic Interactions on CPU and GPU Clusters
| Autores | Christian Ponte-Fernández, Jorge González Domínguez, María J. Martín |
| Revista | INTERNATIONAL JOURNAL OF HIGH PERFORMANCE COMPUTING APPLICATIONS Vol. 34 Núm. 1 (págs. 20 a 29) |
| DOI | https://doi.org/10.1177/1094342019852128 |
Toxo: a library for calculating penetrance tables of high-order epistasis models
| Autores | Christian Ponte-Fernández, Jorge González Domínguez, Antonio Carvajal Rodríguez, María J. Martín |
| Revista | BMC BIOINFORMATICS Vol. 21 Núm. 138 |
SMusket: Spark-based DNA error correction on distributed-memory systems
| Autores | Roberto R. Expósito, Jorge González Domínguez, Juan Touriño Domínguez |
| Revista | FUTURE GENERATION COMPUTER SYSTEMS Vol. 111 (págs. 698 a 713) |
| DOI | https://doi.org/10.1016/j.future.2019.10.038 |
SeQual: Big Data Tool to Perform Quality Control and Data Preprocessing of Large NGS Datasets
| Autores | Roberto Rey Expósito, Roi Galego-Torreiro, Jorge González Domínguez |
| Revista | IEEE Access Vol. 8 (págs. 146075 a 146084) |
| DOI | https://doi.org/10.1109/access.2020.3015016 |
Accelerating Binary Biclustering on Platforms with CUDA-enabled GPU
| Autores | Jorge González Domínguez, Roberto Rey Expósito |
| Revista | Information Sciences Vol. 496 (págs. 317 a 325) |
| DOI | https://doi.org/10.1016/j.ins.2018.05.025 |
Parallel Feature Selection for Distributed-Memory Clusters
| Autores | Jorge González Domínguez, Verónica Bolón-Canedo, Freire C., Borja, Juan Touriño Domínguez |
| Revista | Information Sciences Vol. 496 (págs. 399 a 409) |
| DOI | https://doi.org/10.1016/j.ins.2019.01.050 |
CUDA-JMI: Acceleration of Feature Selection on Heterogeneous Systems
| Autores | Jorge González Domínguez, Roberto R. Expósito, Verónica Bolón-Canedo |
| Revista | FUTURE GENERATION COMPUTER SYSTEMS Vol. 102 (págs. 426 a 436) |
parSRA: A Framework for the Parallel Execution of Short Read Aligners on Compute Clusters
| Autores | Jorge González Domínguez, Christian Hundt, Bertil Schmidt |
| Revista | Journal of Computational Science Vol. 25 (págs. 134 a 139) |
ParBiBit: Parallel tool for binary biclustering on modern distributed-memory systems
| Autores | Jorge González Domínguez, Roberto Rey Expósito |
| Revista | PLOS ONE Vol. 13 Núm. 4 |
| DOI | https://doi.org/10.1371/journal.pone.0194361 |
HSRA: Hadoop-based spliced read aligner for RNA sequencing data
| Autores | Roberto Rey Expósito, Jorge González Domínguez, Juan Touriño Domínguez |
| Revista | PLOS ONE Vol. 13 Núm. 7 (págs. 1 a 25) |
| DOI | https://doi.org/10.1371/journal.pone.0201483 |
MPIGeneNet: Parallel Calculation of Gene Co-Expression Networks on Multicore Clusters
| Autores | Jorge González Domínguez, María J. Martín |
| Revista | IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics Vol. 15 Núm. 5 (págs. 1732 a 1737) |
| DOI | https://doi.org/10.1109/tcbb.2017.2761340 |
Accelerating Binary Biclustering on Platforms with CUDA-enabled GPU
| Autores | Jorge González Domínguez, Roberto Rey Expósito |
| Revista | Information Sciences |
MarDRe: Efficient MapReduce-based Removal of Duplicate DNA Reads in the Cloud
| Autores | Roberto Rey Expósito, Jorge Veiga Fachal, Jorge González Domínguez, Juan Touriño Domínguez |
| Revista | BIOINFORMATICS Vol. 33 Núm. 17 (págs. 2762 a 2764) |
Speed and Accuracy Improvement of Higher-Order Epistasis Detection on CUDA-enabled GPUs
| Autores | Daniel Jünger, Christian Hundt, Jorge González Domínguez, Bertil Schmidt |
| Revista | Cluster Computing Vol. 20 Núm. 3 (págs. 1899 a 1908) |
| DOI | https://doi.org/10.1007/s10586-017-0938-9 |
Parallel Definition of Tear Film Maps on Distributed-Memory Clusters for the Support of Dry Eye Diagnosis
| Autores | Jorge González Domínguez, Bea Remeseiro, María J. Martín |
| Revista | Computer Methods and Programs in Biomedicine Vol. 139 (págs. 51 a 60) |
| DOI | https://doi.org/10.1016/j.cmpb.2016.10.027 |
Parallel Pairwise Epistasis Detection on Heterogeneous Computing Architectures
| Autores | Jorge González Domínguez, Sabela Ramos Garea, Juan Touriño Domínguez, Bertil Schmidt |
| Revista | IEEE TRANSACTIONS ON PARALLEL AND DISTRIBUTED SYSTEMS Vol. 27 Núm. 8 (págs. 2329 a 2340) |
Multithreaded and Spark Parallelization of Feature Selection Filters
| Autores | Carlos Eiras-Franco, Verónica Bolón-Canedo, Sabela Ramos Garea, Jorge González Domínguez, Amparo Alonso-Betanzos, Juan Touriño Domínguez |
| Revista | Journal of Computational Science Vol. 17 (págs. 609 a 619) |
MSAProbs-MPI: Parallel Multiple Sequence Aligner for Distributed-Memory Systems
| Autores | Jorge González Domínguez, Yongchao Liu, Bertil Schmidt, Juan Touriño Domínguez |
| Revista | BIOINFORMATICS Vol. 32 Núm. 24 (págs. 3826 a 3828) |
ParDRe: Faster Parallel Duplicated Reads Removal Tool for Sequencing Studies
| Autores | Jorge González Domínguez, Bertil Schmidt |
| Revista | BIOINFORMATICS (págs. 1562 a 1564) |
| DOI | https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btw038 |
Parallel and Scalable Short-read Alignment on Multi-core Clusters using UPC++
| Autores | Jorge González Domínguez, Bertil Schmidt, Yongchao Liu |
| Revista | PLOS ONE Vol. 11 Núm. 1 (págs. 1 a 15) |
| DOI | https://doi.org/10.1371/journal.pone.0145490 |
Large-Scale Genome-Wide Association Studies on a GPU Cluster Using a CUDA-Accelerated PGAS Programming Model
| Autores | Jorge González Domínguez, Jan C. Kässens, Lars Wienbrandt, Bertil Schmidt |
| Revista | INTERNATIONAL JOURNAL OF HIGH PERFORMANCE COMPUTING APPLICATIONS Vol. 29 Núm. 4 (págs. 506 a 510) |
| DOI | https://doi.org/10.1177/1094342015585846 |
Parallelizing Epistasis Detection in GWAS on FPGA and GPU-accelerated Computing Systems
| Autores | Jorge González Domínguez, Lars Wienbrandt, Jan C. Kässens, David Ellinghaus, Manfred Schimmler, Bertil Schmidt |
| Revista | IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics Vol. 12 Núm. 5 (págs. 982 a 994) |
| DOI | https://doi.org/10.1109/tcbb.2015.2389958 |
High-Speed Exhaustive 3-locus Interaction Epistasis Analysis on FPGAs
| Autores | Jan C. Kässens, Lars Wienbrandt, Jorge González Domínguez, Bertil Schmidt, Manfred Schimmler |
| Revista | Journal of Computational Science Vol. 9 (págs. 131 a 136) |
| DOI | https://doi.org/10.1016/j.jocs.2015.04.030 |
GPU-Accelerated Exhaustive Search for Third-Order Epistatic Interactions in Case-Control Studies
| Autores | Jorge González Domínguez, Bertil Schmidt |
| Revista | Journal of Computational Science Vol. 8 (págs. 93 a 100) |
| DOI | https://doi.org/10.1016/j.jocs.2015.04.001 |
A 2D algorithm with asymmetric workload for the UPC conjugate gradient method
| Autores | Jorge González-Domínguez, Osni A. Marques, María J. Martín, Juan Touriño Domínguez |
| Revista | JOURNAL OF SUPERCOMPUTING Vol. 70 Núm. 2 (págs. 816 a 829) |
| DOI | https://doi.org/10.1007/s11227-014-1300-0 |
Scalable PGAS Collective Operations in NUMA Clusters
| Autores | Damián Álvarez Mallón, Guillermo López Taboada, Carlos Teijeiro Barjas, Jorge González Domínguez, Andrés Gómez Tato, Brian Wibecan |
| Revista | Cluster Computing Vol. 17 Núm. 4 (págs. 1473 a 1495) |
Analysis of I/O Performance on an Amazon EC2 Cluster Compute and High I/O Platform
| Autores | Roberto Rey Expósito, Guillermo López Taboada, Sabela Ramos Garea, Jorge González Domínguez, Juan Touriño Domínguez, Ramón Doallo |
| Revista | Journal of Grid Computing Vol. 11 Núm. 4 (págs. 613 a 631) |
| DOI | https://doi.org/10.1007/s10723-013-9250-y |
The Servet 3.0 benchmark suite: Characterization of network performance degradation
| Autores | Jorge González-Domínguez, María J. Martín, Guillermo López Taboada, Roberto Rey Expósito, Juan Touriño Domínguez |
| Revista | COMPUTERS & ELECTRICAL ENGINEERING Vol. 39 Núm. 8 (págs. 2483 a 2493) |
| DOI | https://doi.org/10.1016/j.compeleceng.2013.08.012 |
Performance evaluation of sparse matrix products in UPC
| Autores | Jorge González-Domínguez, Óscar García-López, Guillermo López Taboada, María J. Martín, Juan Touriño Domínguez |
| Revista | JOURNAL OF SUPERCOMPUTING Vol. 64 Núm. 1 (págs. 100 a 109) |
| DOI | https://doi.org/10.1007/s11227-012-0796-4 |
A Parallel Numerical Library for UPC
| Autores | Jorge González Domínguez, María J. Martín, Guillermo López Taboada, Juan Touriño Domínguez, Ramón Doallo, Andrés Gómez Tato |
| Revista | LECTURE NOTES IN COMPUTER SCIENCE Vol. 5704 (págs. 630 a 641) |
Parallel Programming: Concepts and Practice
| Autores | Bertil Schmidt, Jorge González Domínguez, Christian Hundt, Moritz Schlarb |
| Editorial | Morgan Kaufmann, () |
| ISBN | 9780128498903 |
Fast and Accurate Multiple Sequence Alignment with MSAProbs-MPI
| Autores | Jorge González Domínguez |
| Libro |
Multiple Sequence Alignment (Methods in Molecular Biology series) Edita Springer Nature Switzerland . ISBN: 978-1-0716-1035-0 |
| Páginas | De la 39 a la 47 |
HPC Tools to Deal with Microarray Data
| Autores | Jorge González Domínguez. Roberto Rey Expósito |
| Libro |
Microarray Bioinformatics Edita Springer. ISBN: 978-1-4939-9441-0 |
| Páginas | De la 227 a la 243 |
High-Order Epistasis Detection in High Performance Computing Systems
| Autor | Christian Ponte Fernández |
| Director/es | Jorge González Domínguez; María José Martín Santamaría |
| Ámbito | Facultad de Informática |
| Calificación | Sobresaliente Cum Laude |
Parallel Construction of RNA Databases for Extensive lncRNA-RNA Interaction Prediction
The 38th ACM/SIGAPP Symposium on Applied Computing, SAC 2023
Internacional
| Autores | Iñaki Amatria-Barral, Jorge González Domínguez, Juan Touriño Domínguez |
| Lugar | Tallin (Estonia) |
| DOI | https://doi.org/10.1145/3555776.3577772 |
Analysis of the Construction of Similarity Matrices on Multi-core and Many-core Plat- forms Using Different Similarity Metrics
19th International Conference on Computational Science (ICCS 2019)
Internacional
| Autores | Uxía Casal, Jorge González Domínguez, María J. Martín |
| Lugar | Faro (Portugal) |
| DOI | https://doi.org/10.1007/978-3-030-22734-0_13 |
Evaluation of OpenMP SIMD Directives on Xeon Phi Coprocessors
15th International Conference on High Performance Computing and Simulation (HPCS 2017)
Internacional
| Autores | Christian Ponte, Jorge González Domínguez, María J. Martín |
| Lugar | Genoa (Italia) |
| DOI | https://doi.org/10.1109/hpcs.2017.65 |
Fast Parallel Construction of Correlation Similarity Matrices for Gene Co-Expression Networks on Multicore Clusters.
17th International Conference on Computational Science (ICCS 2017)
Internacional
| Autores | Jorge González Domínguez, María J. Martín |
| Lugar | Zurich (Suiza) |
| DOI | https://doi.org/10.1016/j.procs.2017.05.023 |
Ultra-Fast Detection of Higher-Order Epistatic Interactions on GPUs
4th International Workshop on Parallelism in Bioinformatics (PBio 2016, in conjunction with Euro-Par 2016)
Internacional
| Autores | Daniel Jünger, Christian Hundt, Jorge González Domínguez, Bertil Schmidt |
| Lugar | Grenoble (Francia) |
| DOI | https://doi.org/10.1007/978-3-319-58943-5_34 |
Combining GPU and FPGA Technology for Efficient Exhaustive Interaction Analysis in GWAS
27th IEEE International Conference on Application-specific Systems, Architectures and Processors (ASAP 2016)
Internacional
| Autores | Jan C. Kässens, Lars Wienbrandt, Manfred Schimmler, Jorge González Domínguez, Bertil Schmidt |
| Lugar | London (Reino Unido) |
| DOI | https://doi.org/10.1109/asap.2016.7760788 |
Acceleration of Tear Film Map Definition on Multicore Systems
16th International Conference on Computational Science (ICCS 2016)
Internacional
| Autores | Jorge González Domínguez, Beatriz Remeseiro, María J. Martín |
| Lugar | San Diego, CA (Estados Unidos) |
| DOI | https://doi.org/10.1016/j.procs.2016.05.296 |
Using a CUDA-Accelerated PGAS Model on a GPU Cluster for Bioinformatics
GPU Technology Conference (GTC 2015)
Internacional
| Autores | Jorge González Domínguez, Bertil Schmidt |
| Lugar | San Jose, CA (Estados Unidos) |
Faster Compressed Sparse Row (CSR)-based Sparse Matrix-Vector Multiplication using CUDA
GPU Technology Conference (GTC 2015)
Internacional
| Autores | Yongchao Liu, Jorge González Domínguez, Bertil Schmidt |
| Lugar | San Jose, CA (Estados Unidos) |
The Parallel Conjugate Gradient Method using Unified Parallel C
International Conference on Computational and Mathematical Methods in Science and Engineering, CMMSE 2014
Internacional
| Autores | Jorge González-Domínguez, Osni A. Marques, María J. Martín, Juan Touriño Domínguez |
| Organizador | Univ. de Cádiz |
| Lugar | Rota (España) |
The Impact of Workload Strategies on a UPC-based CG
16th SIAM Conference on Parallel Processing for Scientific Computing
Internacional
| Autores | Jorge González-Domínguez, Osni A. Marques, María J. Martín, Juan Touriño Domínguez |
| Organizador | SIAM |
| Lugar | Portland, Oregon (Estados Unidos) |
UPC++ for Bioinformatics: A Case Study Using Genome-Wide Association Studies.
15th IEEE International Conference on Cluster Computing (Cluster 2014)
Internacional
| Autores | Jan C. Kässens, Jorge González Domínguez, Lars Wienbrandt, Bertil Schmidt |
| Lugar | Madrid (España) |
| DOI | https://doi.org/10.1109/cluster.2014.6968770 |
Analyzing the Energy Efficiency of the Memory Subsystem in Multicore Processors
12th IEEE International Symposium on Parallel and Distributed Processing with Applications (ISPA 2014)
Internacional
| Autores | Sandra Catalán, Jorge González Domínguez, Rafael Mayo Gual, Enrique S. Quintana-Ortí |
| Lugar | Milan (Italia) |
| DOI | https://doi.org/10.1109/ispa.2014.11 |
Hybrid CPU/GPU Acceleration of Detection of 2-SNP Epistatic Interactions in GWAS
20th International Conference Euro-Par 2014 Parallel Processing
Internacional
| Autores | Jorge González Domínguez, Bertil Schmidt, Jan C. Kässens, Lars Wienbrandt |
| Lugar | Porto (Portugal) |
| DOI | https://doi.org/10.1007/978-3-319-09873-9_57 |
FPGA-Based Acceleration of Detecting Statistical Epistasis in GWAS
14th International Conference on Computational Science (ICCS 2014)
Internacional
| Autores | Lars Wienbrandt, Jan C. Kässens, Jorge González Domínguez, Bertil Schmidt, David Ellinghaus, Manfred Schimmler |
| Lugar | Cairns (Australia) |
| DOI | https://doi.org/10.1016/j.procs.2014.05.020 |
Servet: A Benchmark Suite for Autotuning on Multicore Clusters
24th IEEE International Parallel and Distributed Processing Symposium (IPDPS¿2010)
Internacional
| Autores | Jorge González Domínguez, Guillermo López Taboada, Basilio B. Fraguela, María J. Martín, Juan Touriño Domínguez |
| Lugar | Atlanta (Estados Unidos) |
Servet: una suite de benchmarks para el soporte del autotuning en clusters de sistemas multinúcleo
XXI Jornadas de Paralelismo
Nacional
| Autores | Jorge González Domínguez, Guillermo López Taboada, Basilio B. Fraguela, María J. Martín, Juan Touriño Domínguez |
| Lugar | Valencia (España) |
Una Biblioteca Numérica Paralela para UPC
XX Jornadas de Paralelismo
Nacional
| Autores | Jorge González Domínguez, María J. Martín, Guillermo López Taboada, Juan Touriño Domínguez, Ramón Doallo, Andrés Gómez Tato |
| Lugar | Coruña, A (España) |
Cargos académicos o de gestión para el/la docente.