| Departamento | Enxeñaría de Computadores |
| Área | Arquitectura e tecnoloxía de computadoras |
| Investigación | Grupo de investigación Grupo de Arquitectura de Computadores |
| Liñas de investigación | Aínda non figuran no xestor curricular da UDC (SUXI). |
| Avaliación de méritos docentes | 2 quinquenio(s) |
| Avaliación de méritos de investigación | 2 sexenio(s) |
| Contacto | Directorio da UDC |
| Orcid id0000-0002-2602-4874 ResearcherIDH-7371-2016 Scopus35113258100 | |
Neste apartado móstrase a docencia impartida en graos, másteres e resto de titulacións oficiais ata os últimos 6 anos.
| Materia e estudos en que se imparte | Carácter | Horas a distancia | Horas totais |
|---|---|---|---|
|
Aplicacións e Tendencias en Bioinformática e Enxeñaría Biomédica
Máster Universitario en Bioinformática para Ciencias da Saúde
|
Optativo | 0 | 8,5 |
|
Computación de Altas Prestacións en Bioinformática
Máster Universitario en Bioinformática para Ciencias da Saúde
|
Obrigatorio | 0 | 42 |
|
Concorrencia e Paralelismo
Grao en Enxeñaría Informática
|
Obrigatorio | 0 | 30 |
|
Prácticas en Empresa
Máster Universitario en Bioinformática para Ciencias da Saúde
Máster Universitario en Bioinformática para Ciencias da Saúde
|
Optativo | 0 | 0,5 |
|
Prácticas Profesionais
Máster Universitario en Computación de Altas Prestacións / High Performance Computing
|
Obrigatorio | 0 | 5 |
|
Procesamento Paralelo Avanzado
Grao en Ciencia e Enxeñaría de Datos
|
Optativo | 0 | 14 |
|
Programación de Arquitecturas Heteroxéneas
Máster Universitario en Computación de Altas Prestacións / High Performance Computing
|
Obrigatorio | 8 | 24 |
|
Traballo Fin de Grao. Mención en Computación
Grao en Enxeñaría Informática
|
Obrigatorio | 0 | 2 |
|
Traballo Fin de Grao. Mención en Enxeñaría do Software
Grao en Enxeñaría Informática
Grao en Enxeñaría Informática. Curso Ponte
|
Obrigatorio | 0 | 1,5 |
|
Traballo Fin de Grao. Mención en Sistemas de Información
Grao en Enxeñaría Informática
|
Obrigatorio | 0 | 0,5 |
|
Traballo Fin de Máster
Máster Universitario en Computación de Altas Prestacións / High Performance Computing
|
Obrigatorio | 0 | 25 |
|
Traballo Fin de Máster
Máster Universitario en Bioinformática para Ciencias da Saúde
|
Obrigatorio | 0 | 11,5 |
| Materia e estudos en que se imparte | Carácter | Horas a distancia | Horas totais |
|---|---|---|---|
| Aplicacións e Tendencias en Bioinformática e Enxeñaría Biomédica | Optativo | 0 | 8,5 |
| Computación de Altas Prestacións en Bioinformática | Obrigatorio | 0 | 42 |
| Concorrencia e Paralelismo | Obrigatorio | 0 | 46 |
| Prácticas Profesionais | Obrigatorio | 0 | 2 |
| Procesamento Paralelo Avanzado | Optativo | 0 | 14 |
| Programación de Arquitecturas Heteroxéneas | Obrigatorio | 8 | 24 |
| Traballo Fin de Grao. Mención en Computación | Obrigatorio | 0 | 6,5 |
| Traballo Fin de Máster | Obrigatorio | 0 | 44,33 |
| Traballo Fin de Máster | Obrigatorio | 0 | 12,66 |
| Materia e estudos en que se imparte | Carácter | Horas a distancia | Horas totais |
|---|---|---|---|
|
Aplicacións e Tendencias en Bioinformática e Enxeñaría Biomédica
Máster Universitario en Bioinformática para Ciencias da Saúde
|
Optativo | 0 | 8,5 |
|
Computación de Altas Prestacións en Bioinformática
Máster Universitario en Bioinformática para Ciencias da Saúde
|
Obrigatorio | 0 | 41 |
|
Concorrencia e Paralelismo
Grao en Enxeñaría Informática
|
Obrigatorio | 0 | 40 |
|
Prácticas Profesionais
Máster Universitario en Computación de Altas Prestacións / High Performance Computing
|
Obrigatorio | 0 | 2 |
|
Procesamento Paralelo Avanzado
Grao en Ciencia e Enxeñaría de Datos
|
Optativo | 0 | 14 |
|
Programación de Arquitecturas Heteroxéneas
Máster Universitario en Computación de Altas Prestacións / High Performance Computing
|
Obrigatorio | 8 | 24 |
|
Traballo Fin de Grao. Mención en Computación
Grao en Enxeñaría Informática
|
Obrigatorio | 0 | 4 |
|
Traballo Fin de Máster
Máster Universitario en Computación de Altas Prestacións / High Performance Computing
|
Obrigatorio | 0 | 56,5 |
| Materia e estudos en que se imparte | Carácter | Horas a distancia | Horas totais |
|---|---|---|---|
|
Aplicacións e Tendencias en Bioinformática e Enxeñaría Biomédica
Máster Universitario en Bioinformática para Ciencias da Saúde
|
Optativo | 0 | 8,5 |
|
Computación de Altas Prestacións en Bioinformática
Máster Universitario en Bioinformática para Ciencias da Saúde
|
Obrigatorio | 0 | 41 |
|
Concorrencia e Paralelismo
Grao en Enxeñaría Informática
|
Obrigatorio | 0 | 80 |
|
Procesamento Paralelo Avanzado
Grao en Ciencia e Enxeñaría de Datos
|
Optativo | 0 | 14 |
|
Programación de Arquitecturas Heteroxéneas
Máster Universitario en Computación de Altas Prestacións / High Performance Computing
|
Obrigatorio | 8 | 22 |
|
Traballo Fin de Grao. Mención en Computación
Grao en Enxeñaría Informática
|
Obrigatorio | 0 | 4 |
|
Traballo Fin de Grao. Mención en Enxeñaría de Computadores
Grao en Enxeñaría Informática
|
Obrigatorio | 0 | 4 |
|
Traballo Fin de Grao. Mención en Tecnoloxías da Información
Grao en Enxeñaría Informática
Grao en Enxeñaría Informática. Curso Ponte
|
Obrigatorio | 0 | 4 |
|
Traballo Fin de Máster
Máster Universitario en Computación de Altas Prestacións / High Performance Computing
|
Obrigatorio | 0 | 15 |
| Materia e estudos en que se imparte | Carácter | Horas a distancia | Horas totais |
|---|---|---|---|
|
Aplicacións e Tendencias en Bioinformática e Enxeñaría Biomédica
Máster Universitario en Bioinformática para Ciencias da Saúde
|
Optativo | 0 | 8,5 |
|
Computación de Altas Prestacións en Bioinformática
Máster Universitario en Bioinformática para Ciencias da Saúde
|
Obrigatorio | 0 | 42 |
|
Concorrencia e Paralelismo
Grao en Enxeñaría Informática
|
Obrigatorio | 0 | 50 |
|
Prácticas en Empresa
Máster Universitario en Bioinformática para Ciencias da Saúde
Máster Universitario en Bioinformática para Ciencias da Saúde
|
Optativo | 0 | 0,5 |
|
Programación de Arquitecturas Heteroxéneas
Máster Universitario en Computación de Altas Prestacións / High Performance Computing
|
Obrigatorio | 16 | 30 |
|
Traballo Fin de Grao. Mención en Computación
Grao en Enxeñaría Informática
|
Obrigatorio | 0 | 4 |
|
Traballo Fin de Máster
Máster Universitario en Computación de Altas Prestacións / High Performance Computing
|
Obrigatorio | 0 | 20 |
| Materia e estudos en que se imparte | Carácter | Horas a distancia | Horas totais |
|---|---|---|---|
|
Aplicacións e Tendencias en Bioinformática e Enxeñaría Biomédica
Máster Universitario en Bioinformática para Ciencias da Saúde
|
Optativo | 0 | 8,5 |
|
Computación de Altas Prestacións en Bioinformática
Máster Universitario en Bioinformática para Ciencias da Saúde
|
Obrigatorio | 0 | 42 |
|
Programación de Arquitecturas Heteroxéneas
Máster Universitario en Computación de Altas Prestacións / High Performance Computing
|
Obrigatorio | 16 | 30 |
|
Traballo Fin de Grao. Mención en Enxeñaría do Software
Grao en Enxeñaría Informática
Grao en Enxeñaría Informática. Curso Ponte
|
Obrigatorio | 0 | 4 |
|
Traballo Fin de Máster
Máster Universitario en Computación de Altas Prestacións / High Performance Computing
|
Obrigatorio | 0 | 5 |
Titorías definidas polo/a docente para o curso académico 2024/2025.
| Cuadrimestre | Día | Lugar |
|---|---|---|
| Primeiro cuadrimestre |
martes
10:30 a 12:30 |
D. 3.08 Área Científica |
| Primeiro cuadrimestre |
mércores
10:30 a 12:30 |
D. 3.08 Área Científica |
| Primeiro cuadrimestre |
xoves
10:30 a 12:30 |
D. 3.08 Área Científica |
| Segundo cuadrimestre |
luns
12:30 a 14:30 |
D 3.08 (Área Científica) |
| Segundo cuadrimestre |
mércores
12:30 a 14:30 |
D 3.08 (Área Científica) |
| Segundo cuadrimestre |
xoves
10:30 a 12:30 |
D 3.08 (Área Científica) |
| Segunda oportunidade |
martes
10:30 a 12:30 |
D 3.08 (Área Científica) |
| Segunda oportunidade |
mércores
10:30 a 12:30 |
D 3.08 (Área Científica) |
| Segunda oportunidade |
xoves
10:30 a 12:30 |
D 3.08 (Área Científica) |
Dirixidos ou codirixidos polo/a docente desde o ano 2013.
| Aceleración dun método de identificación de rexións con metilación específica de alelos en clústers de sistemas multinúcleo |
| Análise do algoritmo do Bandido Multi-Armado para un caso de distribución de cálculo nun entorno IOT |
| Construción en paralelo de bases de datos para predición de interaccións de ARN |
| Convolución 3D en paralelo |
| Desenvolvemento de algoritmos paralelos de 'Procura do Veciño máis Lonxano' |
| Desenvolvemento dun método paralelo de descubrimento de repeticións longas en tándem para sistemas de memoria distribuida |
| É posible predicir o prezo das accións con Aprendizaxe Profunda? |
| Estudo comparativo de análise de datos feito entre python e Power Query para integración en Power Bi |
| Extracción e estructuración de información a partires de CVs |
| Montaxe dun cluster de probas reutilizando recursos HPC |
| Predición dun partido de fútbol e os goles esperados |
| Visión e aprendizaxe dinámica aplicada ao censo de animais salvaxes |
| Aceleración dun algoritmo de selección de características en GPUs |
| Aceleración dun método de selección de características online en contornos Big Data |
| Clasificación automática de informes de clientes mediante Procesamento de Linguaxe Natural |
| Paralelización da formación de redes neuronais profundas de procesamento de linguaxe natural en plataformas distribuídas con procesadores multicore e GPUs |
| pRIblast: unha aplicación paralela de alta eficiencia para a predición de interaccións ARN-ARN |
| Unha ferramenta paralela para a identificación de rexións diferencialmente metiladas en análises xenómicas |
| Desenvolvemento dunha ferramenta para o control de calidade de secuencias xenéticas en contornos BigData |
| Paralelización de ARACNe, un algoritmo para a reconstrución de redes de regulación xenética. |
Pode consultar os méritos de investigación seleccionando un tipo de mérito e o ano.
Arquitecturas, Frameworks y Aplicaciones de la Computación de Altas Prestaciones
| Entidade financiadora | Ministerio de Ciencia e Innovación |
| Investigadores principais | TOURIÑO DOMÍNGUEZ JUAN (IP1) / RODRIGUEZ ÁLVAREZ GABRIEL (IP2) |
| Tipo | Proxecto Programas Nacionales |
| Datas | Desde 01/09/2023 ata 31/08/2026 |
Algoritmos de selección de características verdes y rápidos
| Entidade financiadora | Ministerio de Ciencia e Innovación |
| Investigadores principais | Verónica Bolón Canedo |
| Tipo | Proxecto Programas Nacionales |
| Datas | Desde 01/12/2022 ata 30/11/2024 |
AXUDAS PARA A CONSOLIDACIÓN E ESTRUTURACIÓN DE UNIDADES DE INVESTIGACIÓN COMPETITIVAS.GRC 2021
| Entidade financiadora | Consellería de Cultura, Educación e Ordenación Universitaria |
| Investigadores principais | Juan Touriño Domínguez |
| Tipo | Proxecto Programas Autonomicos |
| Datas | Desde 01/01/2021 ata 20/11/2024 |
Desafíos Actuales en HPC: Arquitecturas, Software y Aplicaciones
| Entidade financiadora | Ministerio de Ciencia e Innovación |
| Investigadores principais | Touriño Dominguez, Juan e Doallo Biempica, Ramón |
| Tipo | Proxecto Programas Nacionales |
| Datas | Desde 01/06/2020 ata 31/05/2023 |
Optimización de métodos de selección de características basados en información mutua para arquitecturas hardware no convencionales (SC-IM-HW)
| Entidade financiadora | Centro de Investigación en Tecnoloxías da Información e as Comunicacións (CITIC) |
| Investigadores principais | Jorge González Domínguez |
| Tipo | Proxecto Outros Programas |
| Datas | Desde 01/07/2018 ata 30/09/2019 |
Axudas para a consolidación e estruturación de unidades de investigación competitivas-REDES. Red de Tecnologías Cloud y Big Data para HPC (II)
| Entidade financiadora | Consellería de Cultura, Educación e Ordenación Universitaria |
| Investigadores principais | JUAN TOURIÑO DOMÍNGUEZ |
| Tipo | Proxecto Programas Autonomicos |
| Datas | Desde 01/01/2017 ata 31/12/2018 |
Red de Computación de Altas Prestaciones en Arquitecturas Heterogéneas (CAPAP-H6)
| Entidade financiadora | Ministerio de Economía y Competitividad |
| Investigadores principais | Diego R. Llanos Ferraris |
| Tipo | Proxecto Programas Nacionales |
| Datas | Desde 01/07/2017 ata 30/06/2019 |
Consolidación y Estructuración de Unidades de Investigación Competitivas: Grupo de Arquitectura de Computadores de la Universidad de A Coruña
| Entidade financiadora | Consellería de Cultura, Educación e Ordenación Universitaria |
| Investigadores principais | Juan Touriño Domínguez |
| Tipo | Proxecto Programas Autonomicos |
| Datas | Desde 25/10/2017 ata 31/12/2020 |
High Performance and Embedded Architecture and Compilation, HiPEAC-5
| Entidade financiadora | Union Europea |
| Investigadores principais | Koen De Bosschere |
| Tipo | Proxecto UE |
| Datas | Desde 01/12/2017 ata 29/02/2020 |
High-Performance and Embedded Architecture and Compilation, HiPEAC-4
| Entidade financiadora | Union Europea |
| Investigadores principais | Koen De Bosschere |
| Tipo | Proxecto UE |
| Datas | Desde 01/01/2016 ata 28/02/2018 |
Axudas para a acreditación, estruturación e mellora de centros de investigación singulares e agrupacións estratéxicas consolidadas do Sistema universitario de Galicia, cofinanciadas polo Fondo Europeo de Desenvolvemento Rexional (Feder), no marco do programa operativo Feder Galicia 2014-2020
| Entidade financiadora | Consellería de Cultura, Educación e Ordenación Universitaria |
| Investigadores principais | Manuel F. González Penedo |
| Tipo | Proxecto Programas Autonomicos |
| Datas | Desde 01/01/2016 ata 30/11/2019 |
NUEVOS DESAFIOS EN COMPUTACION DE ALTAS PRESTACIONES: DESDE ARQUITECTURAS HASTA APLICACIONES (II)
| Entidade financiadora | Ministerio de Economía y Competitividad (MINECO) |
| Investigadores principais | Ramón Doallo Biempica, Juan Touriño Domínguez |
| Tipo | Proxecto Programas Nacionales |
| Datas | Desde 30/12/2016 ata 29/12/2019 |
Red de Computación de Altas Prestaciones en Arquitecturas Heterogéneas (CAPAP-H5)
| Entidade financiadora | Ministerio de Economía y Competitividad |
| Investigadores principais | Arturo González Escribano |
| Tipo | Proxecto Programas Nacionales |
| Datas | Desde 01/01/2015 ata 31/12/2015 |
Network for Sustainable Ultrascale Computing (NESUS)
| Entidade financiadora | Union Europea |
| Investigadores principais | Jesús Carretero Pérez |
| Tipo | Proxecto UE |
| Datas | Desde 28/03/2014 ata 27/03/2018 |
Nuevos Desafíos en Computación de Altas Prestaciones: desde Arquitecturas hasta Aplicaciones
| Entidade financiadora | Ministerio de Economía y Competitividad |
| Investigadores principais | Ramón Doallo Biempica y Juan Touriño Domínguez |
| Tipo | Proxecto Programas Nacionales |
| Datas | Desde 01/01/2014 ata 31/12/2017 |
Red de Tecnologías Cloud y Big Data para HPC
| Entidade financiadora | Xunta de Galicia |
| Investigadores principais | Juan Touriño Domínguez |
| Tipo | Proxecto Programas Autonomicos |
| Datas | Desde 01/01/2014 ata 31/12/2015 |
Consolidación y Estructuración de Unidades de Investigación Competitivas: Grupo de Arquitectura de Computadores de la Universidad de A Coruña (Grupo de Referencia Competitiva)
| Entidade financiadora | Xunta de Galicia |
| Investigadores principais | Ramón Doallo Biempica |
| Tipo | Proxecto Programas Autonomicos |
| Datas | Desde 01/01/2013 ata 31/12/2016 |
Ayudas para la consolidación y estructuración de unidades de investigación competitiva. Modalidad de agrupaciones estratégicas (CITIC)
| Entidade financiadora | Xunta de Galicia |
| Investigadores principais | Ricardo Cao Abad |
| Tipo | Proxecto Programas Autonomicos |
| Datas | Desde 01/01/2012 ata 31/12/2013 |
High-Performance Embedded Architectures and Compilation Network of Excellence, HiPEAC-3 NoE
| Entidade financiadora | Union Europea |
| Investigadores principais | Koen De Bosschere |
| Tipo | Proxecto UE |
| Datas | Desde 01/02/2012 ata 31/01/2016 |
Red de Computación de Altas Prestaciones sobre Arquitecturas Paralelas Heterogéneas (CAPAP-H4)
| Entidade financiadora | Ministerio de Economía y Competitividad |
| Investigadores principais | Diego R. Llanos Ferraris |
| Tipo | Proxecto Programas Nacionales |
| Datas | Desde 15/06/2012 ata 25/04/2014 |
Arquitecturas, Sistemas y Herramientas para Computación de Altas Prestaciones
| Entidade financiadora | Ministerio de Economía y Competitividad |
| Investigadores principais | Ramón Doallo Biempica |
| Tipo | Proxecto Programas Nacionales |
| Datas | Desde 01/01/2011 ata 30/06/2014 |
Open European Network for High Performance Computing on Complex Environments (ComplexHPC)
| Entidade financiadora | Union Europea |
| Investigadores principais | Emmanuel Jeannot |
| Tipo | Proxecto UE |
| Datas | Desde 07/05/2009 ata 06/07/2013 |
pRIblast: A parallel application for IncRNA-RNA interaction prediction
| Tipo | Software Rexistrado |
| Entidade | Universidade da Coruña |
| Autores | Iñaki Amatria-Barral, Jorge González Domínguez, Juan Touriño Domínguez |
| Data de solicitude | 31/03/2023 |
| Data de concesión | 13/10/2023 |
Parallel-FST: Feature Selection Library for Clusters
| Tipo | Software Rexistrado |
| Entidade | Universidade da Coruña |
| Autores | Bieito Beceiro Fernández, Jorge González Domínguez, Juan Touriño Domínguez |
| Data de solicitude | 05/08/2022 |
| Data de concesión | 14/04/2023 |
PyToxo
| Tipo | Software Rexistrado |
| Entidade | |
| Autores | Christian Ponte, María J. Martín, Borja González-Seoane, Jorge González Domínguez |
| Data de solicitude | 06/08/2021 |
| Data de concesión | 05/11/2021 |
Cuda joint mututal information. CUDA-JMI
| Tipo | Software Rexistrado |
| Entidade | UDC |
| Autores | Jorge González Domínguez, Roberto R. Expósito, Verónica Bolón-Canedo |
| Data de solicitude | 06/02/2020 |
| Data de concesión | 22/12/2020 |
MPI3SNP
| Tipo | Software Rexistrado |
| Entidade | UDC |
| Autores | María J. Martín, Jorge González Domínguez, Christian Ponte |
| Data de solicitude | 30/06/2019 |
ParBiBit
| Tipo | Software Rexistrado |
| Entidade | Universidade da Coruña (UDC) |
| Autores | Jorge González Domínguez, Roberto Rey Expósito |
| Data de solicitude | 07/06/2018 |
| Data de concesión | 16/07/2018 |
CUBiBit
| Tipo | Software Rexistrado |
| Entidade | Universidade da Coruña (UDC) |
| Autores | Jorge González Domínguez, Roberto Rey Expósito |
| Data de solicitude | 16/08/2018 |
| Data de concesión | 31/10/2018 |
MPICorMat
| Tipo | Software Rexistrado |
| Entidade | Universidade da Coruña (UDC) |
| Autores | Jorge González Domínguez, María J. Martín |
| Data de solicitude | 27/06/2017 |
| Data de concesión | 14/08/2017 |
MPIGeneNet
| Tipo | Software Rexistrado |
| Entidade | Universidade da Coruña (UDC) |
| Autores | Jorge González Domínguez, María J. Martín |
| Data de solicitude | 02/11/2017 |
| Data de concesión | 14/02/2018 |
MapReduce Duplicate Removal Tool (MarDRe)
| Tipo | Software Rexistrado |
| Entidade | Universidade da Coruña (UDC) |
| Autores | Roberto Rey Expósito, Jorge Veiga Fachal, Jorge González Domínguez, Juan Touriño Domínguez |
| Data de solicitude | 02/11/2017 |
| Data de concesión | 14/02/2018 |
Servet Benchmark Suite
| Tipo | Software Rexistrado |
| Entidade | Universidade da Coruña (UDC) |
| Autores | Jorge González Domínguez, Guillermo López Taboada, Basilio B. Fraguela, María J. Martín, Juan Touriño Domínguez |
| Data de solicitude | 07/08/2013 |
| Data de concesión | 09/01/2014 |
BetaGPU: Harnessing GPU power for parallelized beta distribution functions
| Autores | Alejandro Fernández-Fraga, Jorge González Domínguez, María J. Martín |
| Revista | SoftwareX Vol. 29 |
| DOI | https://doi.org/10.1016/j.so10.1016/j.softx.2024.102009ftx.2024.101666 |
Biclustering in bioinformatics using big data and High Performance Computing applications: challenges and perspectives, a review
| Autores | Aurelio López-Fernández, Francisco A. Gómez-Vela, Domingo S. Rodríguez-Baena, Fernando M. Delgado-Chaves, Jorge González Domínguez |
| Revista | JOURNAL OF SUPERCOMPUTING Vol. 81 |
| DOI | https://doi.org/10.1007/s11227-025-07563-6 |
BigDEC: A multi-algorithm Big Data tool based on the k-mer spectrum method for scalable short-read error correction
| Autores | Roberto R. Expósito, Jorge González Domínguez |
| Revista | FUTURE GENERATION COMPUTER SYSTEMS Vol. 154 (páxs. 314 ata 329) |
| DOI | https://doi.org/10.1016/j.future.2024.01.011 |
bioScience: A new python science library for high-performance computing bioinformatics analytics
| Autores | Aurelio López-Fernández, Francisco A. Gómez-Vela, Jorge González Domínguez, Parameshachari Bidare-Divakarachari |
| Revista | SoftwareX Vol. 26 |
| DOI | https://doi.org/10.1016/j.softx.2024.101666 |
CUDA Acceleration of MI-based Feature Selection Methods
| Autores | Bieito Beceiro Fernández, Jorge González Domínguez, Laura Morán-Fernández, Verónica Bolón-Canedo, Juan Touriño Domínguez |
| Revista | JOURNAL OF PARALLEL AND DISTRIBUTED COMPUTING Vol. 190 (páxs. 1 ata 17) |
| DOI | https://doi.org/10.1016/j.jpdc.2024.104901 |
PARamrfinder: Detecting allele-specific DNA methylation on Multicore Clusters
| Autores | Alejandro Fernández-Fraga, Jorge González Domínguez, María J. Martín |
| Revista | JOURNAL OF SUPERCOMPUTING (páxs. 14573 ata 14599) |
| DOI | https://doi.org/10.1007/s11227-024-05939-8 |
Considerations in the search for epistasis
| Autores | Jorge González Domínguez |
| Revista | Genome Biology Vol. 25 Núm. 1 |
| DOI | https://doi.org/10.1186/s13059-024-03427-z |
pRIblast: A Highly Efficient Parallel Application for Comprehensive lncRNA-RNA Interaction Prediction
| Autores | Iñaki Amatria-Barral, Jorge González Domínguez, Juan Touriño Domínguez |
| Revista | FUTURE GENERATION COMPUTER SYSTEMS Vol. 138 (páxs. 270 ata 279) |
| DOI | https://doi.org/10.1016/j.future.2022.08.014 |
PATO: Genome-wide Prediction of lncRNA-DNA Triple Helices
| Autores | Iñaki Amatria-Barral, Jorge González Domínguez, Juan Touriño Domínguez |
| Revista | BIOINFORMATICS Vol. 39 Núm. 3 (páxs. 1 ata 3) |
| DOI | https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btad134 |
ParRADMeth: Identification of Differentially Methylated Regions on Multicore Clusters
| Autores | Alejandro Fernández-Fraga, Jorge González Domínguez, Juan Touriño Domínguez |
| Revista | IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics Vol. 20 Núm. 3 (páxs. 2041 ata 2049) |
| DOI | https://doi.org/10.1109/tcbb.2022.3230473 |
MPI-dot2dot: A parallel tool to find DNA tandem repeats on multicore clusters
| Autores | Jorge González Domínguez, José M Martín-Martínez, Roberto Rey Expósito |
| Revista | JOURNAL OF SUPERCOMPUTING Vol. 78 (páxs. 4217 ata 4235) |
| DOI | https://doi.org/10.1007/s11227-021-04025-7 |
A SIMD Algorithm for the Detection of Epistatic Interactions of any Order
| Autores | Christian Ponte, María J. Martín, Jorge González Domínguez |
| Revista | FUTURE GENERATION COMPUTER SYSTEMS Vol. 132 (páxs. 108 ata 123) |
| DOI | https://doi.org/10.1016/j.future.2022.02.009 |
Evaluation of Existing Methods for High-Order Epistasis Detection
| Autores | Christian Ponte-Fernández, Jorge González Domínguez, Antonio Carvajal Rodríguez, María J. Martín |
| Revista | IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics Vol. 19 Núm. 2 (páxs. 912 ata 926) |
| DOI | https://doi.org/10.1109/tcbb.2020.3030312 |
PyToxo: a Python tool for calculating penetrance tables of high-order epistasis models
| Autores | Borja González-Seoane, Christian Ponte-Fernández, Jorge González Domínguez, María J. Martín |
| Revista | BMC BIOINFORMATICS Vol. 23 Núm. 117 |
| DOI | https://doi.org/10.1186/s12859-022-04645-7 |
Parallel-FST: a Feature Selection Library for Multicore Clusters
| Autores | Bieito Beceiro Fernández, Jorge González Domínguez, Juan Touriño Domínguez |
| Revista | JOURNAL OF PARALLEL AND DISTRIBUTED COMPUTING Vol. 169 (páxs. 106 ata 116) |
| DOI | https://doi.org/10.1016/j.jpdc.2022.06.012 |
Fiuncho: a program for any-order epistasis detection in CPU clusters
| Autores | Christian Ponte-Fernández, Jorge González Domínguez, María J. Martín |
| Revista | JOURNAL OF SUPERCOMPUTING Vol. 78 (páxs. 15338 ata 15357) |
| DOI | https://doi.org/10.1007/s11227-022-04477-5 |
ScalaParBiBit: scaling the binary biclustering in distributed-memory systems
| Autores | Basilio B. Fraguela, Diego Andrade Canosa, Jorge González Domínguez |
| Revista | Cluster Computing Vol. 24 Núm. 3 (páxs. 2249 ata 2268) |
| DOI | https://doi.org/10.1007/s10586-021-03261-z |
Fast Search of Third-Order Epistatic Interactions on CPU and GPU Clusters
| Autores | Christian Ponte-Fernández, Jorge González Domínguez, María J. Martín |
| Revista | INTERNATIONAL JOURNAL OF HIGH PERFORMANCE COMPUTING APPLICATIONS Vol. 34 Núm. 1 (páxs. 20 ata 29) |
| DOI | https://doi.org/10.1177/1094342019852128 |
Toxo: a library for calculating penetrance tables of high-order epistasis models
| Autores | Christian Ponte-Fernández, Jorge González Domínguez, Antonio Carvajal Rodríguez, María J. Martín |
| Revista | BMC BIOINFORMATICS Vol. 21 Núm. 138 |
SMusket: Spark-based DNA error correction on distributed-memory systems
| Autores | Roberto R. Expósito, Jorge González Domínguez, Juan Touriño Domínguez |
| Revista | FUTURE GENERATION COMPUTER SYSTEMS Vol. 111 (páxs. 698 ata 713) |
| DOI | https://doi.org/10.1016/j.future.2019.10.038 |
SeQual: Big Data Tool to Perform Quality Control and Data Preprocessing of Large NGS Datasets
| Autores | Roberto Rey Expósito, Roi Galego-Torreiro, Jorge González Domínguez |
| Revista | IEEE Access Vol. 8 (páxs. 146075 ata 146084) |
| DOI | https://doi.org/10.1109/access.2020.3015016 |
Accelerating Binary Biclustering on Platforms with CUDA-enabled GPU
| Autores | Jorge González Domínguez, Roberto Rey Expósito |
| Revista | Information Sciences Vol. 496 (páxs. 317 ata 325) |
| DOI | https://doi.org/10.1016/j.ins.2018.05.025 |
Parallel Feature Selection for Distributed-Memory Clusters
| Autores | Jorge González Domínguez, Verónica Bolón-Canedo, Freire C., Borja, Juan Touriño Domínguez |
| Revista | Information Sciences Vol. 496 (páxs. 399 ata 409) |
| DOI | https://doi.org/10.1016/j.ins.2019.01.050 |
CUDA-JMI: Acceleration of Feature Selection on Heterogeneous Systems
| Autores | Jorge González Domínguez, Roberto R. Expósito, Verónica Bolón-Canedo |
| Revista | FUTURE GENERATION COMPUTER SYSTEMS Vol. 102 (páxs. 426 ata 436) |
parSRA: A Framework for the Parallel Execution of Short Read Aligners on Compute Clusters
| Autores | Jorge González Domínguez, Christian Hundt, Bertil Schmidt |
| Revista | Journal of Computational Science Vol. 25 (páxs. 134 ata 139) |
ParBiBit: Parallel tool for binary biclustering on modern distributed-memory systems
| Autores | Jorge González Domínguez, Roberto Rey Expósito |
| Revista | PLOS ONE Vol. 13 Núm. 4 |
| DOI | https://doi.org/10.1371/journal.pone.0194361 |
HSRA: Hadoop-based spliced read aligner for RNA sequencing data
| Autores | Roberto Rey Expósito, Jorge González Domínguez, Juan Touriño Domínguez |
| Revista | PLOS ONE Vol. 13 Núm. 7 (páxs. 1 ata 25) |
| DOI | https://doi.org/10.1371/journal.pone.0201483 |
MPIGeneNet: Parallel Calculation of Gene Co-Expression Networks on Multicore Clusters
| Autores | Jorge González Domínguez, María J. Martín |
| Revista | IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics Vol. 15 Núm. 5 (páxs. 1732 ata 1737) |
| DOI | https://doi.org/10.1109/tcbb.2017.2761340 |
Accelerating Binary Biclustering on Platforms with CUDA-enabled GPU
| Autores | Jorge González Domínguez, Roberto Rey Expósito |
| Revista | Information Sciences |
MarDRe: Efficient MapReduce-based Removal of Duplicate DNA Reads in the Cloud
| Autores | Roberto Rey Expósito, Jorge Veiga Fachal, Jorge González Domínguez, Juan Touriño Domínguez |
| Revista | BIOINFORMATICS Vol. 33 Núm. 17 (páxs. 2762 ata 2764) |
Speed and Accuracy Improvement of Higher-Order Epistasis Detection on CUDA-enabled GPUs
| Autores | Daniel Jünger, Christian Hundt, Jorge González Domínguez, Bertil Schmidt |
| Revista | Cluster Computing Vol. 20 Núm. 3 (páxs. 1899 ata 1908) |
| DOI | https://doi.org/10.1007/s10586-017-0938-9 |
Parallel Definition of Tear Film Maps on Distributed-Memory Clusters for the Support of Dry Eye Diagnosis
| Autores | Jorge González Domínguez, Bea Remeseiro, María J. Martín |
| Revista | Computer Methods and Programs in Biomedicine Vol. 139 (páxs. 51 ata 60) |
| DOI | https://doi.org/10.1016/j.cmpb.2016.10.027 |
Parallel Pairwise Epistasis Detection on Heterogeneous Computing Architectures
| Autores | Jorge González Domínguez, Sabela Ramos Garea, Juan Touriño Domínguez, Bertil Schmidt |
| Revista | IEEE TRANSACTIONS ON PARALLEL AND DISTRIBUTED SYSTEMS Vol. 27 Núm. 8 (páxs. 2329 ata 2340) |
Multithreaded and Spark Parallelization of Feature Selection Filters
| Autores | Carlos Eiras-Franco, Verónica Bolón-Canedo, Sabela Ramos Garea, Jorge González Domínguez, Amparo Alonso-Betanzos, Juan Touriño Domínguez |
| Revista | Journal of Computational Science Vol. 17 (páxs. 609 ata 619) |
MSAProbs-MPI: Parallel Multiple Sequence Aligner for Distributed-Memory Systems
| Autores | Jorge González Domínguez, Yongchao Liu, Bertil Schmidt, Juan Touriño Domínguez |
| Revista | BIOINFORMATICS Vol. 32 Núm. 24 (páxs. 3826 ata 3828) |
ParDRe: Faster Parallel Duplicated Reads Removal Tool for Sequencing Studies
| Autores | Jorge González Domínguez, Bertil Schmidt |
| Revista | BIOINFORMATICS (páxs. 1562 ata 1564) |
| DOI | https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btw038 |
Parallel and Scalable Short-read Alignment on Multi-core Clusters using UPC++
| Autores | Jorge González Domínguez, Bertil Schmidt, Yongchao Liu |
| Revista | PLOS ONE Vol. 11 Núm. 1 (páxs. 1 ata 15) |
| DOI | https://doi.org/10.1371/journal.pone.0145490 |
Large-Scale Genome-Wide Association Studies on a GPU Cluster Using a CUDA-Accelerated PGAS Programming Model
| Autores | Jorge González Domínguez, Jan C. Kässens, Lars Wienbrandt, Bertil Schmidt |
| Revista | INTERNATIONAL JOURNAL OF HIGH PERFORMANCE COMPUTING APPLICATIONS Vol. 29 Núm. 4 (páxs. 506 ata 510) |
| DOI | https://doi.org/10.1177/1094342015585846 |
Parallelizing Epistasis Detection in GWAS on FPGA and GPU-accelerated Computing Systems
| Autores | Jorge González Domínguez, Lars Wienbrandt, Jan C. Kässens, David Ellinghaus, Manfred Schimmler, Bertil Schmidt |
| Revista | IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics Vol. 12 Núm. 5 (páxs. 982 ata 994) |
| DOI | https://doi.org/10.1109/tcbb.2015.2389958 |
High-Speed Exhaustive 3-locus Interaction Epistasis Analysis on FPGAs
| Autores | Jan C. Kässens, Lars Wienbrandt, Jorge González Domínguez, Bertil Schmidt, Manfred Schimmler |
| Revista | Journal of Computational Science Vol. 9 (páxs. 131 ata 136) |
| DOI | https://doi.org/10.1016/j.jocs.2015.04.030 |
GPU-Accelerated Exhaustive Search for Third-Order Epistatic Interactions in Case-Control Studies
| Autores | Jorge González Domínguez, Bertil Schmidt |
| Revista | Journal of Computational Science Vol. 8 (páxs. 93 ata 100) |
| DOI | https://doi.org/10.1016/j.jocs.2015.04.001 |
A 2D algorithm with asymmetric workload for the UPC conjugate gradient method
| Autores | Jorge González-Domínguez, Osni A. Marques, María J. Martín, Juan Touriño Domínguez |
| Revista | JOURNAL OF SUPERCOMPUTING Vol. 70 Núm. 2 (páxs. 816 ata 829) |
| DOI | https://doi.org/10.1007/s11227-014-1300-0 |
Scalable PGAS Collective Operations in NUMA Clusters
| Autores | Damián Álvarez Mallón, Guillermo López Taboada, Carlos Teijeiro Barjas, Jorge González Domínguez, Andrés Gómez Tato, Brian Wibecan |
| Revista | Cluster Computing Vol. 17 Núm. 4 (páxs. 1473 ata 1495) |
Analysis of I/O Performance on an Amazon EC2 Cluster Compute and High I/O Platform
| Autores | Roberto Rey Expósito, Guillermo López Taboada, Sabela Ramos Garea, Jorge González Domínguez, Juan Touriño Domínguez, Ramón Doallo |
| Revista | Journal of Grid Computing Vol. 11 Núm. 4 (páxs. 613 ata 631) |
| DOI | https://doi.org/10.1007/s10723-013-9250-y |
The Servet 3.0 benchmark suite: Characterization of network performance degradation
| Autores | Jorge González-Domínguez, María J. Martín, Guillermo López Taboada, Roberto Rey Expósito, Juan Touriño Domínguez |
| Revista | COMPUTERS & ELECTRICAL ENGINEERING Vol. 39 Núm. 8 (páxs. 2483 ata 2493) |
| DOI | https://doi.org/10.1016/j.compeleceng.2013.08.012 |
Performance evaluation of sparse matrix products in UPC
| Autores | Jorge González-Domínguez, Óscar García-López, Guillermo López Taboada, María J. Martín, Juan Touriño Domínguez |
| Revista | JOURNAL OF SUPERCOMPUTING Vol. 64 Núm. 1 (páxs. 100 ata 109) |
| DOI | https://doi.org/10.1007/s11227-012-0796-4 |
A Parallel Numerical Library for UPC
| Autores | Jorge González Domínguez, María J. Martín, Guillermo López Taboada, Juan Touriño Domínguez, Ramón Doallo, Andrés Gómez Tato |
| Revista | LECTURE NOTES IN COMPUTER SCIENCE Vol. 5704 (páxs. 630 ata 641) |
Parallel Programming: Concepts and Practice
| Autores | Bertil Schmidt, Jorge González Domínguez, Christian Hundt, Moritz Schlarb |
| Editorial | Morgan Kaufmann, () |
| ISBN | 9780128498903 |
Fast and Accurate Multiple Sequence Alignment with MSAProbs-MPI
| Autores | Jorge González Domínguez |
| Libro |
Multiple Sequence Alignment (Methods in Molecular Biology series) Edita Springer Nature Switzerland . ISBN: 978-1-0716-1035-0 |
| Páxinas | Desde a 39 ata a 47 |
HPC Tools to Deal with Microarray Data
| Autores | Jorge González Domínguez. Roberto Rey Expósito |
| Libro |
Microarray Bioinformatics Edita Springer. ISBN: 978-1-4939-9441-0 |
| Páxinas | Desde a 227 ata a 243 |
High-Order Epistasis Detection in High Performance Computing Systems
| Autor | Christian Ponte Fernández |
| Director/es | Jorge González Domínguez; María José Martín Santamaría |
| Ámbito | Facultad de Informática |
| Cualificación | Sobresaliente Cum laude |
Applying dynamic balancing to improve the performance of MPI parallel genomics applications
39th ACM/SIGAPP Symposium on Applied Computing
Internacional
| Autores | Alejandro Fernández-Fraga, Jorge González Domínguez, María J. Martín |
| Lugar | Ávila (España) |
| DOI | https://doi.org/10.1145/3605098.3635986 |
Parallel Construction of RNA Databases for Extensive lncRNA-RNA Interaction Prediction
The 38th ACM/SIGAPP Symposium on Applied Computing, SAC 2023
Internacional
| Autores | Iñaki Amatria-Barral, Jorge González Domínguez, Juan Touriño Domínguez |
| Lugar | Tallin (Estonia) |
| DOI | https://doi.org/10.1145/3555776.3577772 |
Analysis of the Construction of Similarity Matrices on Multi-core and Many-core Plat- forms Using Different Similarity Metrics
19th International Conference on Computational Science (ICCS 2019)
Internacional
| Autores | Uxía Casal, Jorge González Domínguez, María J. Martín |
| Lugar | Faro (Portugal) |
| DOI | https://doi.org/10.1007/978-3-030-22734-0_13 |
Evaluation of OpenMP SIMD Directives on Xeon Phi Coprocessors
15th International Conference on High Performance Computing and Simulation (HPCS 2017)
Internacional
| Autores | Christian Ponte, Jorge González Domínguez, María J. Martín |
| Lugar | Genoa (Italia) |
| DOI | https://doi.org/10.1109/hpcs.2017.65 |
Fast Parallel Construction of Correlation Similarity Matrices for Gene Co-Expression Networks on Multicore Clusters.
17th International Conference on Computational Science (ICCS 2017)
Internacional
| Autores | Jorge González Domínguez, María J. Martín |
| Lugar | Zurich (Suiza) |
| DOI | https://doi.org/10.1016/j.procs.2017.05.023 |
Ultra-Fast Detection of Higher-Order Epistatic Interactions on GPUs
4th International Workshop on Parallelism in Bioinformatics (PBio 2016, in conjunction with Euro-Par 2016)
Internacional
| Autores | Daniel Jünger, Christian Hundt, Jorge González Domínguez, Bertil Schmidt |
| Lugar | Grenoble (Francia) |
| DOI | https://doi.org/10.1007/978-3-319-58943-5_34 |
Combining GPU and FPGA Technology for Efficient Exhaustive Interaction Analysis in GWAS
27th IEEE International Conference on Application-specific Systems, Architectures and Processors (ASAP 2016)
Internacional
| Autores | Jan C. Kässens, Lars Wienbrandt, Manfred Schimmler, Jorge González Domínguez, Bertil Schmidt |
| Lugar | London (Reino Unido) |
| DOI | https://doi.org/10.1109/asap.2016.7760788 |
Acceleration of Tear Film Map Definition on Multicore Systems
16th International Conference on Computational Science (ICCS 2016)
Internacional
| Autores | Jorge González Domínguez, Beatriz Remeseiro, María J. Martín |
| Lugar | San Diego, CA (Estados Unidos) |
| DOI | https://doi.org/10.1016/j.procs.2016.05.296 |
Using a CUDA-Accelerated PGAS Model on a GPU Cluster for Bioinformatics
GPU Technology Conference (GTC 2015)
Internacional
| Autores | Jorge González Domínguez, Bertil Schmidt |
| Lugar | San Jose, CA (Estados Unidos) |
Faster Compressed Sparse Row (CSR)-based Sparse Matrix-Vector Multiplication using CUDA
GPU Technology Conference (GTC 2015)
Internacional
| Autores | Yongchao Liu, Jorge González Domínguez, Bertil Schmidt |
| Lugar | San Jose, CA (Estados Unidos) |
The Parallel Conjugate Gradient Method using Unified Parallel C
International Conference on Computational and Mathematical Methods in Science and Engineering, CMMSE 2014
Internacional
| Autores | Jorge González-Domínguez, Osni A. Marques, María J. Martín, Juan Touriño Domínguez |
| Organizador | Univ. de Cádiz |
| Lugar | Rota (España) |
The Impact of Workload Strategies on a UPC-based CG
16th SIAM Conference on Parallel Processing for Scientific Computing
Internacional
| Autores | Jorge González-Domínguez, Osni A. Marques, María J. Martín, Juan Touriño Domínguez |
| Organizador | SIAM |
| Lugar | Portland, Oregon (Estados Unidos) |
UPC++ for Bioinformatics: A Case Study Using Genome-Wide Association Studies.
15th IEEE International Conference on Cluster Computing (Cluster 2014)
Internacional
| Autores | Jan C. Kässens, Jorge González Domínguez, Lars Wienbrandt, Bertil Schmidt |
| Lugar | Madrid (España) |
| DOI | https://doi.org/10.1109/cluster.2014.6968770 |
Analyzing the Energy Efficiency of the Memory Subsystem in Multicore Processors
12th IEEE International Symposium on Parallel and Distributed Processing with Applications (ISPA 2014)
Internacional
| Autores | Sandra Catalán, Jorge González Domínguez, Rafael Mayo Gual, Enrique S. Quintana-Ortí |
| Lugar | Milan (Italia) |
| DOI | https://doi.org/10.1109/ispa.2014.11 |
Hybrid CPU/GPU Acceleration of Detection of 2-SNP Epistatic Interactions in GWAS
20th International Conference Euro-Par 2014 Parallel Processing
Internacional
| Autores | Jorge González Domínguez, Bertil Schmidt, Jan C. Kässens, Lars Wienbrandt |
| Lugar | Porto (Portugal) |
| DOI | https://doi.org/10.1007/978-3-319-09873-9_57 |
FPGA-Based Acceleration of Detecting Statistical Epistasis in GWAS
14th International Conference on Computational Science (ICCS 2014)
Internacional
| Autores | Lars Wienbrandt, Jan C. Kässens, Jorge González Domínguez, Bertil Schmidt, David Ellinghaus, Manfred Schimmler |
| Lugar | Cairns (Australia) |
| DOI | https://doi.org/10.1016/j.procs.2014.05.020 |
Servet: A Benchmark Suite for Autotuning on Multicore Clusters
24th IEEE International Parallel and Distributed Processing Symposium (IPDPS¿2010)
Internacional
| Autores | Jorge González Domínguez, Guillermo López Taboada, Basilio B. Fraguela, María J. Martín, Juan Touriño Domínguez |
| Lugar | Atlanta (Estados Unidos) |
Servet: una suite de benchmarks para el soporte del autotuning en clusters de sistemas multinúcleo
XXI Jornadas de Paralelismo
Nacional
| Autores | Jorge González Domínguez, Guillermo López Taboada, Basilio B. Fraguela, María J. Martín, Juan Touriño Domínguez |
| Lugar | Valencia (España) |
Una Biblioteca Numérica Paralela para UPC
XX Jornadas de Paralelismo
Nacional
| Autores | Jorge González Domínguez, María J. Martín, Guillermo López Taboada, Juan Touriño Domínguez, Ramón Doallo, Andrés Gómez Tato |
| Lugar | Coruña, A (España) |
Cargos académicos ou de xestión para o/a docente.